雷晨 刘胜利 于婷乔 陈玉珍 卢存福

（北京林业大学生物科学与技术学院 林木育种国家工程实验室 教育部林木花卉遗传育种重点实验室，北京 100083）

研究报告

沙冬青AmCIP基因结构及其内含子生物信息学分析

雷晨 刘胜利 于婷乔 陈玉珍 卢存福

（北京林业大学生物科学与技术学院 林木育种国家工程实验室 教育部林木花卉遗传育种重点实验室，北京 100083）

旨在分析沙冬青AmCIP基因DNA序列结构特性及功能。以沙冬青AmCIP基因的cDNA序列设计引物，采用PCR扩增其DNA序列，并利用生物信息学方法分析基因的结构。序列分析表明，沙冬青AmCIP基因DNA序列长1 548 bp，包含2个外显子和1个内含子，GenBank登录号KU744005。在该基因的ORF内存在一个78 bp的内含子序列，同时内含子序列中含有参与厌氧诱导的类增强子元件（GC-motif）和光响应元件（TCCC-motif），3'-UTR区域含有多个参与光响应、胁迫响应和激素响应等相关的顺式作用元件，而5'-UTR区域只含有赤霉素响应元件（GARE-motif），这些元件可能对AmCIP基因转录表达起调控作用。此外，该基因具有较高的A+T碱基含量（64.7%），AmCIP的内含子不具有GT-AG规则的保守序列，即内含子5'碱基是GT，3'碱基是TG，推测AmCIP的mRNA具有独特的剪切机制。

沙冬青；脱水素基因AmCIP；外显子；内含子；生物信息学分析

胚胎发育晚期丰富蛋白（Late embryonic abundant，简称LEA）与种子抵抗脱水有关，它伴随种子的成熟过程产生，大量积累于种子成熟后期特定阶段，在种子萌发后很快消失［1］。研究发现，LEA蛋白在种子干旱中积累，以及在干旱、低温、高温或盐胁迫等逆境导致的缺水情况下，在植物组织或生殖组织也会大量积累［2，3］。……