基于高通量测序技术分析糖尿病与肠道菌群相关性的研究进展
2016-06-13刘冬恋廖梦玲周欢
生物技术通报 2016年9期
刘冬恋 廖梦玲 周欢
(成都医学院药学院,成都 610083)
技术与方法
基于高通量测序技术分析糖尿病与肠道菌群相关性的研究进展
刘冬恋 廖梦玲 周欢
(成都医学院药学院,成都 610083)
肠道菌群与糖尿病的发生发展密切相关,随着高通量测序技术的发展,越来越多的研究表明,糖尿病状态下,宿主肠道菌群的群落结构发生了变化。综述了国际上利用高通量技术研究的糖尿病状态下肠道菌群的差异的最新进展,同时从食物、药物、益生元和粪便菌群移植等方面阐述肠道菌群对糖尿病的调节机制,旨在为预防和治疗糖尿病提供新的思路。
糖尿病;高通量测序;肠道菌群
近年来,肠道细菌与糖尿病的关系日渐被人关注,随着第2代高通量测序技术的普及,对在糖尿病状态下,肠道细菌群落结构的变化的研究已成为主流。本文将一些基于高通量测序技术对糖尿病与肠道菌群相关性的研究进行了综合分析,讨论宿主在糖尿病及治疗状态下其肠道菌群的组成和多样性,旨在为预防和治疗糖尿病提供新的思路。
1 高通量测序技术
高通量测序技术是现代生命科学研究的核心技术之一,它实现了同时对几百万 DNA 分子测序的可能性,达到鉴定微生物的单一基因或全基因组的目的[1]。目前第2代高通量测序平台主要有Roche公司的454焦磷酸测序平台,Illumina公司的Hiseq和Miseq测序平台,以及ABI公司的Solid 4测序平台。
宏基因组(Metagenome)技术是指不经过微生物培养阶段,直接提取环境中总DNA,对微生物基因总和进行研究的技术。……
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