落叶松-杨栅锈菌MKK基因的克隆与生物信息学分析1)
2016-05-30李瑞茜于丹余仲东曹支敏
李瑞茜 于丹 余仲东 曹支敏
(西北农林科技大学,杨凌,712100)
落叶松-杨栅锈菌MKK基因的克隆与生物信息学分析1)
李瑞茜于丹余仲东曹支敏
(西北农林科技大学,杨凌,712100)
摘要利用同源克隆技术,从落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina Kleb.)菌株Wh03中克隆得到酿酒酵母MKK1和MKK2的同源基因,命名为MlpMKK1/2-WH。测序结果显示,MlpMKK1/2-WH基因的开放阅读框长度为1 218 bp,编码405个氨基酸。MlpMKK1/2-WH蛋白具有保守的PKc_Pek1_like和Pkinase结构域。系统进化树分析表明,MlpMKK1/2-WH与柄锈菌属3种锈菌中的同源蛋白亲缘关系最近。
关键词落叶松-杨栅锈菌;MKK基因;同源克隆;生物信息
分类号S718.81;S763.11
Cloning and Bioinformatical Analysis of MKK Gene fromMelampsoralarici-populina//
Li Ruixi, Yu Dan, Yu Zhongdong, Cao Zhimin
(Northwest A & F University, Yangling 712100, P. R. China)//Journal of Northeast Forestry University,2016,44(5):84-87.
By using homology-based cloning method, the geneMlpMKK1/2-WH was cloned and sequenced fromMelampsoralarici-populina(Mlp) Chinese strain Wh03. The full-length ORF ofMlpMKK1/2-WH was 1 218 bp, encoding 405 amino acid residues. The deducedMlpMKK1/2-WH protein contains conserved PKc_Pek1_like and Pkinase domains. By phylogenetic analysis, MlpMKK1/2-WH had the closest relationship with the othologs from three rust fungi belonging to the genusPuccinia.
KeywordsMelampsora larici-populina; MKK gene; Homology cloning; Bioinformatical analysis
丝裂原活化蛋白激酶(MAPKs)级联反应途径在适应环境胁迫和形态调节方面具有重要的作用[1]。在信号转导方面具有关键作用的MAPK级联反应途径在真核生物中普遍存在,一般包括依次被磷酸化而激活的3个相互关联的蛋白激酶[2-3],分别为丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶(MAPKKK或MEKK)、丝裂原活化蛋白激酶激酶(MAPKK或MEK)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)。模式物种酿酒酵母中MAPK信号途径研究的较为深入和全面,主要包含Kss1/Fus3类、Kss1类、Slt2类、Hog1类和Smk1类5种MAPK途径[4]。其中,Bck1-MKK1/MKK2-Slt2类MAPK途径调控酿酒酵母细胞壁完整性并促进其细胞壁的生物合成[5]。在酿酒酵母中,任何一个MKK基因的缺失都没有产生明显的表型缺陷,而MKK1和MKK2基因同时缺失却引起一种对温度敏感但可被渗透压稳定剂抑制的细胞裂解缺陷[6]。研究表明,玉米黑粉病菌MKK1基因比较保守,参与了该物种细胞壁完整性的调控[7]。人类病原新型隐球菌MKK1基因是温度敏感型相关基因,也在维持细胞壁完整性方面具有重要作用,同时该基因的缺失会导致病原菌黑色素产量的下降[8]。……
