基于叶绿体全基因组的贝母属特异性DNA条形码的筛选*
2016-04-10宋经元任风鸣李西文
李 滢,姚 辉,宋经元,任风鸣,李西文,孙 超**
(1.中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193;2.中国中医科学院中药研究所 北京 100700)
基于叶绿体全基因组的贝母属特异性DNA条形码的筛选*
李 滢1,姚 辉1,宋经元1,任风鸣1,李西文2,孙 超1**
(1.中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193;2.中国中医科学院中药研究所 北京 100700)
本研究通过对贝母属4个物种叶绿体基因组进行全局分析,分别查找基因区域和基因间区的高变异区域,筛选用于高效鉴别贝母属植物的新DNA条形码序列。相关研究发现贝母属植物的基因区域序列相似度极高,不适用于DNA条形码鉴定研究;共有7个基因间区可以作为潜在的贝母属植物鉴定的特异性DNA条形码。本研究所构建的DNA条形码筛选方法,为筛选用于难鉴定科属的新的DNA条形码提供了通用的方法体系。
贝母属 叶绿体基因组 DNA条形码 分子鉴定
贝母属Fritillaria是百合科Liliaceae中的一个大属,据电子植物志***记载,贝母属共有约130个物种,主要分布在亚洲和地中海等北半球温带地区。中国有贝母属植物24种及其4个变种,其中15个种为中国的特有物种。贝母属药材以干燥鳞茎入药,具有“清热润肺、化痰止咳”的功效,药用历史悠久[1]。2010版《中国药典》收录的贝母属药材包括川贝母、平贝母、浙贝母、伊贝母、湖北贝母[1]。贝母是典型的多基源药材,以川贝母FRITILLARIAE CIRRHOSAE BULBUS为例,药典共收录的6个物种分别为川贝母F. cirrhosa,暗紫贝母F. unibracteata,甘肃贝母F. przewalskii,梭砂贝母F. delavayi,太白贝母F. taipaiensis,和瓦布贝母F. unibracteata var. wabuensis。据统计,《中国药典》涉及贝母属物种共11个。……
