鸡4种主要RNA病毒病多重感染复合PCR检测方法的建立
2016-02-06李学伍王林建
刘 媛,李学伍,王 丽,谷 雨,王林建
(1.河南科技大学 动物科技学院,河南 洛阳 471023; 2.河南省农业科学院 动物免疫学重点实验室,河南 郑州 450002; 3.河南农业大学 生物工程学院,河南 郑州 450002)
鸡4种主要RNA病毒病多重感染复合PCR检测方法的建立
刘 媛1,李学伍2,王 丽2,谷 雨3,王林建3
(1.河南科技大学 动物科技学院,河南 洛阳 471023; 2.河南省农业科学院 动物免疫学重点实验室,河南 郑州 450002; 3.河南农业大学 生物工程学院,河南 郑州 450002)
依据GenBank中注册的禽流感病毒(AIV)、鸡传染性支气管炎病毒(IBV)、新城疫病毒(NDV)和传染性法氏囊病毒(IBDV)基因组核苷酸序列,通过序列比对获得AIV、IBV、NDV、IBDV的相对保守序列。根据每种病毒的保守序列利用生物学软件分别设计3对特异性引物,4种病毒共设计12对引物,并对12对引物进行模拟筛选,获得匹配最佳的4对引物。对获得的最佳匹配引物进行单项PCR验证,优化复合PCR反应条件,确定最佳的退火温度、引物浓度和TaqDNA聚合酶使用量;经特异性、敏感性及简化PCR试验,最终建立了简易复合PCR检测方法。结果表明,建立的检测方法可同时扩增出4条大小与设计相符的特异性片段,即IBV(146 bp)、NDV(215 bp)、IBDV(345 bp)、AIV(435 bp);建立的复合PCR方法具有较强的敏感性和特异性,能检测出100 pg AIV、IBV、IBDV的cDNA和100 fg NDV的cDNA;将三温热循环改进为二温热循环,即将退火和延伸过程合为一步(62 ℃),大大缩短了反应时间。
禽流感病毒; 鸡传染性支气管炎病毒; 新城疫病毒; 传染性法氏囊病毒; RNA病毒; 复合PCR
禽流感(avian influenza,AI)、鸡传染性支气管炎(infectious bronchitis,IB)、新城疫(Newcastle di-sease,ND)和传染性法氏囊病(infectious bursal di-sease,IBD)是鸡常见的重要RNA病毒病。其中,禽流感……
