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MALDI-TOF质谱检测单条植物线虫

2015-11-29龙海李芳荣李一农凌杏园谢泳桂冯建军郑耘刘亮山

生物技术通讯 2015年5期
关键词:单条雌虫形态学

龙海 ,李芳荣,李一农,凌杏园,谢泳桂,冯建军,郑耘,刘亮山

1.深圳出入境检验检疫局,广东 深圳 518001;2.深圳市检验检疫科学研究院 深圳市外来有害生物检测技术研发重点实验室,广东 深圳 518045

检测技术和方法是口岸植物线虫检测工作中的一个重要环节,关系到能否将检疫性线虫挡在国门之外,不会对我国的生态环境以及林业、农业生产等造成严重危害。目前口岸常用的线虫检测方法是形态学方法,有时也会结合一些基于PCR 的分子生物学方法。形态学方法要求检测人员有丰富的形态学知识以及多年的检测经验,而且对虫态的要求比较严格,有时需要雌虫才能鉴定,对于幼虫往往无法鉴定。而基于PCR的分子生物学方法有时会有假阳性或假阴性的问题出现,如果要进行测序,所需费用也比较高,周期也比较长。为了弥补上述两种方法的不足,在满足口岸快速通关要求的同时提高植物线虫的检测质量,需要尝试新的检测技术和方法。

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrixassisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术的发展为植物线虫检测提供了新的手段。其原理是用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜,而使生物分子电离,离子在电场作用下加速飞过飞行管道,根据到达检测器的飞行时间不同而被检测,即测定离子的质荷比(m/z)与离子的飞行时间成正比。MALDITOF MS 具有灵敏度高、准确度高及分辨率高等特点,为生命科学等领域提供了一种强有力的分析测试手段[1]。近年来,该技术逐渐被用于植物细菌、真菌和线虫的检测中。Stets 等[2]对小麦根部分离的细菌进行了质谱分析,能很好地区分这些细菌菌株。Horká等[3]应用质谱技术对链核盘菌属的4 个种进行了鉴定,能准确地将这4 种真菌区分开。Ahmad 等[4]利用MALDI-TOF MS 能很好地区分南方根结线虫的单条幼虫和雌虫这两种不同的虫态,但样品的前处理很难。Perera 等[5]利 用MALDI-TOF MS 技术成功地鉴定了小麦种瘿线虫,但是线虫样品用量大。

本研究提供了一种用于MALDI-TOF MS 检测单条植物线虫的方法,和已有方法相比,该方法对于线虫的前处理容易操作,所需样品量少,具有结果稳定、背景信号低、灵敏度高等优点。

1 材料与方法

1.1 供试样品

本研究所用样品系香港入境旅检时被截获,经形态学鉴定为短体线虫(Pratylenchusspp)。将分离到的短体线虫转移到1.5 mL Eppendorf 管中,轻微涡旋5 min,4000 r/min离心10 min,去上清液;加入1 mL 灭菌水,轻微涡旋5 min,4000 r/min 离心10 min,去上清液,此步骤重复3次[4]。

如果分离到的线虫量少,可以滴加3 滴灭菌水到载玻片上,挑取单条线虫到第一滴水中清洗,再挑到第二滴水中清洗,最后挑到第三滴水中清洗。

1.2 其他材料

溶剂乙腈、甲酸、三氟乙酸(TFA)为色谱纯,购自Sigma 公司;标准品Peptide Calibration Standard、Protein Calibration StandardⅠ和基质α-氰基-4-羟基肉桂酸(CHCA)购自Burker公司;质谱仪为Burker公司的MALDI-TOF-microflex。

1.3 基质溶液配制

乙腈、水和10% TFA 按体积比2∶1∶1 混合,加入CHCA至过饱和。基质溶液须现用现配。

1.4 蛋白标准样品配制

取990 μL 50%乙腈与10 μL 10% TFA 混匀,取125 μL 混合液加至1 管Peptide Calibration Standard 中,混匀;取125 μL 混合液加至1 管Protein Calibration StandardⅠ中,混匀;从上述2 管中各取等体积的溶液混匀配制成蛋白标准样品,用30%的乙腈按1/5 稀释蛋白标准样品,分装至灭菌PCR 管中,每管5 μL,-20℃保存。

1.5 样品前处理及加样

载玻片上滴加5 μL 70%甲酸和乙腈的等体积混合液;在体视显微镜下挑取一条清洗好的线虫,转移到载玻片的混合液中,压破线虫;用移液枪吸取1.5 μL 混合液(连带线虫一起),滴加到MALDITOF MS 样品板上;取1 μL 蛋白标准样品滴加到MALDI-TOF MS 样品板上;溶液晾干后加1 μL CHCA基质溶液;晾干后备用,每个样品重复3次。

1.6 质谱分析

采用波长337 nm的氮激光源,线性阳离子检测模式,20 000 V 加速电压,延迟时间400 ns,激光强度2200,每个样品点激光随机射击60 个点,每次射击100 次。m/z 采集范围2000~20 000 D,使用标准品对仪器进行校准并作为阳性参照物。每个样品的3个质谱图叠加后作为样品的质谱图。

2 结果

采用MALDI-TOF MS 对单条短体线虫的雌虫和二龄幼虫(J2)分别进行了分析。结果显示(图1),经过清洗和前处理,短体线虫的雌虫和J2 的质谱图都出现了较多的离子峰,图谱基线平滑。雌虫稳定重复出现的质谱峰值分别为m/z 2790、2970、3326、4373、4872、5654、7000、9579 和19161,J2 稳定重复出现的质谱峰值分别为m/z 2185、2790、3036、3326、4063、4373、4929、5380、6999 和11156。对比雌虫和J2 的质谱峰值,在±0.1%的误差范围内,相同的峰值分别为m/z 2790、4373 和7000,其余峰值分别为各自的特征峰。从结果可以看出,MALDI-TOF MS 能够区分出短体线虫的不同虫态。

3 讨论

传统的形态学方法结合PCR为基础的分子生物学方法,是目前口岸植物线虫检疫常用的方法。这种方法有时满足不了口岸“检得出、检得准、检得快”的要求。形态学方法难以鉴定幼虫,分子生物学方法有时会产生假阳性或假阴性,如果要测序,会延长检测周期。MALDI-TOF MS 具有快速、灵敏度高、分辨率高、准确度高等特点,目前国际上有两家实验室用该方法检测植物线虫[4-5]。Perera 等[5]用质谱技术鉴定了大量小麦种瘿线虫,给出了鉴定的特征峰。Ahmad 人[4]对南方根结线虫的单条幼虫和雌虫进行了质谱分析,发现它们有一个相同的质谱峰,雌虫有4个特征峰,幼虫有7个特征峰。这两个实验证明MALDI-TOF MS 能够用于植物线虫种的鉴定,以及区分种内不同的虫态。

图1 单条短体线虫的蛋白质指纹图谱

在植物线虫检疫工作中截获的线虫量较少,往往只能对单条线虫进行检测。在实验中笔者发现,Ahmad[4]处理单条线虫的方法难以操作,很难把单条线虫直接挑到MALDI-TOF MS 样品板上。因此,我们对单条线虫的前处理和加样方法进行了改进,提高了蛋白的提取效率,得到比较好的结果,图谱基线平滑,离子峰较多,特征峰明显。MALDI-TOF MS检测植物线虫耗时短,从样品清洗到得出结果不超过2 h;检测灵敏度高,能够检测单条线虫;结果稳定性好,多次重复试验的结果复现性好。缺点是前期投入大,仪器较昂贵;鉴定植物线虫需要建立相关的数据库,目前植物线虫的数据库比较缺乏。但是,随着质谱技术的不断成熟、仪器成本的降低、相关数据库的不断完善,不久的将来MALDI-TOF MS 将会像PCR技术一样有望成为植物线虫鉴定的利器。

[1]冯建军,龙海,刘新娇,等.MALDI-TOF 质谱技术鉴定植物病原体研究进展[J].植物检疫,2014,28(6):13-18.

[2]Stets M I,Pinto A S,Huergo L F,et al.Rapid identification of bacterial isolates from wheat roots by high resolution whole cell MALDI-TOF MS analysis[J].J Biotechnol,2013,165(3-4):167-174.

[3]Horká M,Kubesová A,Salplachta J,et al.Capillary and gel electromigration techniques and MALDI-TOF MS-suitable tools for identification of filamentous fungi[J].Anal Chim Acta,2012,716:155-162.

[4]Ahmad F,Gopal J,Wu H F.Rapid and highly sensitive detection of single nematode via direct MALDI mass spectrometry[J].Talanta,2012,93:182-185.

[5]Perera M R,Vanstone V A,Jones M G.A novel approach to identify plant parasitic nematodes using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry[J].Rapid Commun Mass Spectrom,2005,19:1454-1460.

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