3种炭疽菌P型ATP酶基因家族分析
2015-10-21孙董董林春花李博勋黄贵修
孙董董 林春花 李博勋 黄贵修



摘 要 P型ATP酶是一类可以被ATP驱动其发生磷酸化的阳离子泵。利用TCDB(Transporter Classification Database)网站数据库中的P型ATP酶氨基酸序列对3种炭疽菌(禾谷炭疽、希金斯炭疽、胶孢炭疽)全基因组数据库进行搜索,结合结构域分析和进化树聚类分析,共找出候选P型ATP酶基因禾谷炭疽菌26个,希金斯炭疽菌37个,胶孢炭疽菌29个。对这些候选基因进行基因功能预测发现其主要参与转运Na+/K+、Ca2+、重金属离子以及磷脂的功能。利用MEME程序分析,从3种炭疽菌中均鉴定获得20个基序,其中有6个基序相同。这为深入研究炭疽菌P型ATP酶家族基因生物学功能奠定了基础。
关键词 炭疽菌;P型ATP酶基因;生物信息;功能预测
中图分类号 S432.4 文献标识码 A
炭疽菌(Colletotrichum spp.)是一类重要的植物病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区[1],其种内变异较多,寄主范围广泛,包括蔬菜、牧草、果树、花卉等数十种重要的经济作物[2]。炭疽菌主要出现在春季和初夏, 侵害木本植物的叶、花、枝、果实,其主要以分生孢子侵染, 分生孢子依靠雨水传播, 或者通过昆虫传播[3]。目前,炭疽菌已经成为研究病原真菌生长发育、侵染过程、信号转导及植物-病原菌互作机理的典型材料[4]。
ATP酶是一类能够水解ATP产生能量,使生物体内的各种阳离子能够逆电化学梯度进行跨膜转运的膜蛋白[5]。植物体内的ATP酶主要有3类,分别是位于质膜上的P型ATP酶;液泡膜上的V 型ATP酶以及与H+跨膜转运相耦联的F型ATP 酶[5]。P型ATP酶是一类可以被ATP驱动其发生磷酸化的阳离子泵,普遍存在于各种生物中,参与生物体许多重要的代谢过程,涉及膜电位的产生、肌肉收缩及去除细胞内有毒离子(Cu+、Ag+、Zn2+、Cd2+、或Pb2+)。……
