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曼氏迭宫绦虫annexinB8的生物信息学分析和基因克隆

2015-10-21梁培1吕刚1周晓君2陈新新1陈小静1符瑞佳1

分子诊断与治疗杂志 2015年3期
关键词:分析

梁培1 吕刚1 周晓君2 陈新新1 陈小静1 符瑞佳1★

·论著·

曼氏迭宫绦虫annexinB8的生物信息学分析和基因克隆

梁培1 吕刚1 周晓君2 陈新新1 陈小静1 符瑞佳1★

目的通过生物信息学预测曼氏迭宫绦虫annexinB8(SmannexinB8)的生物学特征,及潜在功能和结构,并且进行基因克隆,为下一步SmannexinB8参与宿主免疫调节研究提供依据。方法通过NCBI的ORF finder工具对SmannexinB8的开放阅读框进行分析,利用ExPASy网站进行蛋白的物理化学参数、信号肽、跨膜螺旋、潜在分子生物学功能的预测,通过NCBI/BLAST对蛋白保守功能域进行检测。不同物种的annexin序列从NCBI网站获取,并利用Vector NTI suit 8.0和TreeView软件进行分析。利用SWISS-MODEL网站和SPDBV 4.10软件分析SmannexinB8蛋白的三维空间结构。此外,对SmannexinB8基因进行扩增,并克隆到原核表达载体pET-28a(+)。结果SmannexinB8是一个全长基因,编码347个氨基酸。蛋白由4个典型的annexin重复结构域组成,序列当中没有信号肽,是一个稳定的可溶性蛋白分子。三维空间立体结构分析结果显示SmannexinB8是一个保守的蛋白。SmannexinB8与多房棘球绦虫、口膜壳绦虫、细粒棘球绦虫、华支睾吸虫以及人类的annexin基因的同源性分别是68%,67%,65%,46%和40%。分子进化分析显示SmannexinB8与绦虫属的亲源性最近,而与其他物种,如吸虫、哺乳动物亲源性较远。结论SmannexinB8可能具有抑制磷脂酶A2的活性,促进细胞融合、参与调节免疫反应和离子通道形成的功能,可能在参与宿主免疫调节中起到关键性的作用。

曼氏迭宫绦虫;annexin B8;生物信息学分析;多功能

曼氏迭宫绦虫是迭宫绦虫属之一,其主要分布在中国、日本、韩国和泰国[1]。裂头蚴是曼氏迭宫绦虫的幼虫,能够导致严重的人兽共患寄生虫病和威胁公共健康。……

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