长期以来，公立医院的补偿主要来源于财政补助、医疗收入和药品收入等3个方面。根据国务院印发的《“十二五”期间深化医药卫生体制改革规划暨实施方案》提出，推进医药分开，逐步取消药品加成政策，将公立医院补偿由服务收费、药品加成收入和财政补助三个渠道改为服务收费和财政补助两个渠道。在医院人员经费和业务成本费用并未减少甚至有所增加的情况下，医院收入来源的减少肯定会影响医院的正常经营运转，要保证医院服务的效率和群众的利益，就要提高政府对医院的财政专项补助。这样，专项资金在医疗事业经费中所占的比例越来越高，对公立医院专项资金采取必要的措施和方法，管好用好专项资金成为医院提高资金使用效益的关键。

（一）专项资金内涵及管理现状

所谓专项资金，是国家或有关部门下拨的具有专门指定用途或特殊用途的资金。医院的财政专项资金是为促进医疗卫生事业发展，完善医疗服务项目，完成公共医疗服务任务，由财政统一安排，在一定时间内具有指定用途与绩效目标的资金。这种资金，主要有公共卫生保障资金、重点学科、专科建设资金，科研专项资金，基本建设资金和医疗仪器设备购置专项资金等。

1、财政专项资金具有很强的政策性和时效性，但财政资金下拔慢，时间滞后的情况非常普遍。资金一般需经过发改委、财政部门、卫生行政主管部门等环节审批，经过若干程序再由上级财政部门拨付各地方财政部门，然后由财政部门拨付给卫生行政主管部门，最后拨付到公立医院往往已是每年年中或年底，非常影响医院自身健康发展及项目实际执行的进度和效果。……