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Matrilin-1基因rs1149048单核苷酸多态性与青少年特发性脊柱侧凸易感性的Meta分析

2015-03-07刘晓敏陈银河申才良

安徽医药 2015年10期
关键词:易感性等位基因关联性

刘晓敏,陈银河,申才良

(1.安徽医科大学附属省立医院神经内科,安徽 合肥 230001;2.安徽医科大学附属阜阳医院骨科,

安徽 阜阳 236000;3.安徽医科大学第一附属医院骨科,安徽 合肥 230022)



Matrilin-1基因rs1149048单核苷酸多态性与青少年特发性脊柱侧凸易感性的Meta分析

刘晓敏1,陈银河2,申才良3

(1.安徽医科大学附属省立医院神经内科,安徽 合肥230001;2.安徽医科大学附属阜阳医院骨科,

安徽 阜阳236000;3.安徽医科大学第一附属医院骨科,安徽 合肥230022)

摘要:目的综合分析Matrilin-1基因rs1149048单核苷酸多态性(SNP)与青少年特发性脊柱侧凸(AIS)易感性的关系。方法计算机检查Medline、Cochrane图书馆、Ovid、Wiley Online图书馆、EBSCO、 Elsevier Science Direct、Springer、CBM、CNKI、万方、维普等数据库,查询关于Matrilin-1 rs1149048 SNP与AIS易感性的病例对照文献,利用Revman 5.3和Stata12.0软件分析相关数据。结果最终共有4篇文献纳入。结果显示GG基因型[OR=1.21,95%CI(0.93,1.56),P=0.15]、AA基因型[OR=0.92,95%CI(0.75,1.13),P=0.44]与AIS易感性无关联性,G等位基因[OR=1.12,95%CI(1.01,1.24),P=0.03]、A等位基因[OR=0.89,95%CI(0.80,0.99),P=0.03]与AIS易感性有关联性。仅GG基因型有明显异质性(P=0.10,I2=52%),剔除来自日本的研究后,异质性降低(P=0.19,I2=41%),结果发生明显变化[OR=1.39,95%CI(1.10,1.75),P=0.005],提示该研究为异质性来源之一。纳入文献仅4篇,发表偏倚未评估。结论Matrilin-1 rs1149048 G和A等位基因与AIS的易感性有关联性,G等位基因携带者对AIS的易感性增高。

关键词:脊柱侧凸;青少年;Matrilin-1基因;单核苷酸多态性;Meta分析

1资料与方法

1.1检索策略计算机检索国外的Medline、Cochrane图书馆、Ovid、Wiley Online图书馆、EBSCO、Elsevier Science Direct、Springer数据库,国内的CBM、CNKI、万方、维普数据库,均为以上数据库的建库时间至2015年2月。国内数据库以“脊柱侧凸”或“脊柱侧弯”、“matrilin”或“MATN”、“多态性”检索,国外数据库以“scoliosis”、“matrilin”或“MATN”、“polymorphism”检索;自由词检索与主题词检索结合,语种不限。

1.2纳入标准病例对照研究;病例组符合AIS的诊断标准;两组的样本量、基因型或等位基因例数数据明确。

1.3排除标准病例对照研究形式以外的文献;同一单位同一作者或不同作者以雷同或类似内容相对早期发表于不同期刊杂志的文献。

1.4文献筛选和资料提取由前2名研究者分别独立进行文献筛选、阅读纳入的文献全文,提取AIS组和对照组的样本量、基因型或等位基因的例数,意见不同时商讨决定。

1.5方法学质量评价网络在线(http://www.genes.org.uk/software/hardy-weinberg.html)评估对照组次要等位基因频率(minor allele frequency,MAF)。若P≤0.05,提示该原始研究统计效能较低;若P>0.05,提示该原始研究统计效能较高。网络在线(http://ihg.gsf.de/cgi-bin/hw/hwa2.pl)评估对照组基因型频率是否符合hardy-weinberg遗传平衡(hardy-weinberg equilibrium,HWE)。若P≤0.05,提示不符合HWE,原始文献为低质量研究;若P>0.05,提示符合HWE,原始文献为高质量研究[3]。

1.6统计学方法利用RevMan 5.3进行Meta分析。计数资料采用优势比(odds ratio,OR)及其95%置信区间(confidence interval,CI)表示。若异质性明显(P<0.1, I2>50%),Meta分析采用随机效应模型(即M-H,Random模型),且分析异质性来源;若异质性不明显(P≥0.1, I2<50%),采用固定效应模型(即M-H,Fixed模型)[3]。当纳入文献较少(低于10篇)时,发表偏倚不评估[4]。检验水平设置为α= 0.05。

2结果

2.1文献基本情况按检索策略总检出104篇文献,排除不相关文献86篇,获得18篇关于AIS易感性的文献,再排除13篇各数据库重复的文献而获得5篇,全文阅读后发现1篇中文内容和1篇英文内容相似,排除其中1篇中文文献,最终纳入4篇英文文献。文献筛选流程见图1。两组的基本资料见表1。

2.2Meta分析结果

2.2.1GG基因型异质性明显(P=0.10,I2=52%),随机效应模型的结果示两组差异无统计学意义[OR=1.21,95%CI(0.93,1.56),P=0.15],即GG基因型与AIS的易感性无关联性,见图2。

2.2.2AA基因型异质性不明显(P=0.49,I2=0%),固定效应模型的结果示两组差异无统计学意义[OR=0.92,95%CI(0.75,1.13),P=0.44],即AA基因型与AIS的易感性无关联性,见图3。

表1 AIS组和对照组的基本资料

注:a聚合酶链反应限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restriction-fragment-length polymorphism,PCR-RFLP);b实时聚合酶链反应(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)。

2.2.3G等位基因异质性不明显(P=0.15,I2=44%),固定效应模型的结果示两组差异有统计学意义[OR=1.12,95%CI(1.01,1.24),P=0.03],即G等位基因与AIS的易感性有关联性,提示G等位基因携带者对AIS的易感性增加,见图4。

2.2.4A等位基因异质性不明显(P=0.15,I2=44%),固定效应模型的结果示两组差异有统计学意义[OR=0.89,95%CI(0.80,0.99),P=0.03],即A等位基因与AIS的易感性有关联性,提示A等位基因携带者对AIS的易感性降低,见图5。

2.3敏感性分析方法学质量评价显示纳入的4个研究的对照组MAF和HWE均无统计学意义(表1),提示这4个研究均为高质量。仅GG基因型的研究间有明显异质性,当剔除Chen等[6]时异质性降低(P=0.95,I2=0),结果无明显变化[OR=1.07,95%CI(0.91,1.26),P=0.44]。当剔除Bae等[8]时,异质性仍明显(P=0.06,I2=65%),结果也无明显变化[OR=1.26,95%CI(0.91,1.75),P=0.16]。当剔除Yilmaz等[9]时,仍有明显异质性(P=0.05,I2=68%),采用随机效应模型分析,结果未发生明显变化[OR=1.22,95%CI(0.91,1.63),P=0.19]。当剔除Takahashi等[7]时,异质性降低(P=0.19,I2=41%),结果有明显变化[OR=1.39,95%CI(1.10,1.75),P=0.005],提示其为异质性来源之一。

3讨论

Matrilin-1又称软骨基质蛋白,是非胶原性细胞外基质蛋白家族之一,其基因位于1p35区域,主要表达于骨和软骨组织[10-12]。Montanaro等[13]对特发性脊柱侧凸家系的Matrilin-1基因微卫星标记进行传递不平衡检验分析,103 bp位点有明显的优先传递,提示家族性AIS可能与Matrilin-1有关联性。AIS患者Matrilin-1蛋白水平显著比对照组低,在进展型AIS患者中表达更低,提示Matrilin-1蛋白可能与AIS的发病有关[14]。陈志军等[5,15]首先认为Matrilin-1 rs1149048 SNP与AIS的易感性有关联性,且与AIS的严重程度呈正相关。但国外学者在日本人群、韩国人群及土耳其人群中并未证实该位点SNP与AIS的易感性存在关联性或具有预测价值[7-9]。

在GG基因型比较中异质性明显,经敏感性分析异质性可能来源于Takahashi等[7]的研究,但其MAF和HWE结果提示为高质量研究,异质性可能与种族差异,基因分型方法的选用及各研究所选择的病例和对照人群差异有关。Chen等[6]和Bae等[8]的对照组为健康者,而Takahashi等[7]的对照组为部分健康者、部分颈椎后纵韧带骨化患者和膝关节骨性关节炎患者,Yilmaz等[9]的对照组为因不同病因于就诊于康复科的非脊柱侧凸门诊患者。目前尚无关于Matrilin-1基因rs1149048 SNP与颈椎后纵韧带骨化和骨性关节炎易感性有无关联性的报道,选用患者作为对照组对结果是否有影响,尚无证据支持。

结合多个数据库进行检索以防漏检文献,同时以主题词与自由词检索提高文献查全率,并制定规范的文献筛选标准,剔除重复报道的文献,将选择偏倚控制至最小。本研究的局限性在于语言偏倚,仅纳入了英文和中文文献,除中英文文献外可能还有其他语种的文献未被检索及纳入。4个研究中心采用的基因检测方法不完全相同,有研究内偏倚,可能对结果有一定的影响。

综上所述,除Matrilin-1 rs1149048 GG和AA基因型外,仅能明确G和A等位基因与AIS的易感性有关联性,G等位基因携带者对AIS的易感性增高,可能为AIS易感的因素之一。后期仍需进行设计良好(年龄匹配、对照组为健康人群等)、大样本的病例对照研究进一步证实Matrilin-1 rs1149048 SNP与AIS易感性的关系。

参考文献:

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[5]陈志军,邱勇,俞杨,等.Matrilin-1基因多态性与青少年特发性脊柱侧凸易感性的关系[J].中华外科杂志,2009,47(17):1332-1335.

[6]Chen Z,Tang NL,Cao X,et al.Promoter polymorphism of matrilin-1 gene predisposes to adolescent idiopathic scoliosis in a Chinese population[J].Eur J Hum Genet,2009,17(4):525-532.

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[9]Yilmaz H,Zateri C,Uludag A,et al.Single-nucleotide polymorphism in Turkish patients with adolescent idiopathic scoliosis:curve progression is not related with MATN-1,LCT C/T-13910,and VDR BsmI[J].J Orthop Res,2012,30(9):1459-1463.

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[14] 王斌,陈志军,邱勇,等.青少年特发性脊柱侧凸患者血浆matrilin-1蛋白水平及其临床意义[J].中华外科杂志,2009,47(21):1638-1641.

[15] 陈志军,邱勇,王斌,等.Matrilin-1基因多态性对青少年特发性脊柱侧凸进展的预测价值[J].中华骨科杂志,2009,29(5):499-502.

A Meta-analysis on the association between rs1149048 polymorphism of

Matrilin-1 gene and susceptibility to adolescent idiopathic scoliosis

LIU Xiao-min1,CHEN Yin-he2,SHEN Cai-liang3

(1.DepartmentofNeurology,theAffiliatedProvincialHospitalofAnhuiMedicalUniversity,Hefei,Anhui230001,

China;2.DepartmentofOrthopaedicSurgery,theAffiliatedFuyangHospitalofAnhuiMedicalUniversity,Fuyang,

Anhui236000,China;3.DepartmentofOrthopaedicSurgery,theFirstAffiliatedHospitalofAnhuiMedical

University,Hefei,Anhui230022,China)

Abstract:ObjectiveTo investigate the association between rs1149048 polymorphism of Matrilin-1 gene and the susceptibility to AIS by a meta-analysis.MethodsCase-control studies were searched from Medline,Cochrane Library,Ovid,Wiley Online Library,EBSCO,Elsevier Science Direct,Springer,CBM,CNKI,Wan Fang and Wei Pu databases for the association between Matrilin-1 rs1149048 polymorphisms and the susceptibility to AIS.Meta-analysis was performed by Revman 5.3 and Stata 12.0 software.Pooled odds ratio(OR)with 95% confidence interval(CI)were derived from random-effects or fixed-effects models to assess the strength of the association.ResultsFour case-control studies were included in the final meta-analysis.No statistically significant differences between AIS and controls group were observed between the susceptibility to AIS and Matrilin-1 rs1149048 genotype GG [OR=1.21,95%CI(0.93,1.56),P=0.15] and AA [OR=0.92,95%CI(0.75,1.13),P=0.44];however,significant differences in allele G [OR=1.12,95%CI(1.01,1.24),P=0.03] and allele A [OR=0.89,95%CI(0.80,0.99),P=0.03] were observed between AIS and control groups.There was obvious heterogeneity among the studies in Genotype GG(P=0.10,I2=52%),sensitivity analysis performed by omitting one study at a time.When a Japanese study was omitted,the heterogeneity decreased(P=0.19,I2=41%),and the pooled results were statistically significant [OR=1.39,95%CI(1.10,1.75),P=0.005],indicating that it might be a source of heterogeneity.Because there were only four studies included,the assessment of publication bias was not performed.ConclusionsThis meta-analysis reveals that alleles G and A of Matrilin-1 rs1149048 are associated with the susceptibility to AIS.G-allele carriers have higher susceptibility.

Key words:scoliosis;adolescent;Matrilin-1;single nucleotide polymorphism;Meta-analysis青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)是青少年期最常见的脊柱畸形,发病率为2%~3%[1]。AIS的发病机制仍未明确,AIS的家族聚集现象提示遗传因素在其发病中可能起一定作用[2]。目前国内外报道数篇Matrilin-1基因rs1149048单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与AIS易感性的研究,结论不统一,为明确AIS易感性与Matrilin-1 rs1149048 SNP的关联性而行此Meta分析。

(收稿日期:2015-03-10,修回日期:2015-05-25)

doi:10.3969/j.issn.1009-6469.2015.10.026

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