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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制及同源性分析

2015-01-12张筠邓在春马红映吕丹汪丽

中国现代医生 2015年27期
关键词:烯酶烯类克雷伯

张筠 邓在春 马红映 吕丹 汪丽

1.宁波大学医学院附属医院呼吸科,浙江宁波315000;2.宁波大学医学院附属医院细菌室,浙江宁波315000

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制及同源性分析

张筠1邓在春1马红映1吕丹1汪丽2

1.宁波大学医学院附属医院呼吸科,浙江宁波315000;2.宁波大学医学院附属医院细菌室,浙江宁波315000

目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制,并进行同源性分析。方法选择2010年1月~2014年12月189株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌株进行分析,采用Hodge方法测定碳青霉烯酶表型,采用B-last方法测定超广谱β内酰胺酶、PCR进行耐药基因测序,REP-PCR方法进行同源性分析。结果189株菌株对厄他培南、头孢噻肟、头孢他啶、亚胺培南、阿莫西林/克拉维酸、氨曲南、美洛培南、头孢西丁的耐药率均超过90%。对米诺环素的耐药率相对较低,对替加环素的耐药率为0。改良Hodge法检测碳青霉烯酶阳性率79.9%,广谱β-内酰胺酶检测阳性率54.0%。KPC基因阳性率60.3%,IMP基因阳性率3.7%;Amp-C酶基因阳性率12.7%;162株blaSHV阳性,阳性率85.7%,其中blaSHV-11为优势基因;120株blaTEM阳性,其中blaTEM-1为优势基因;90株blaCTM-M阳性,其中blaCTM-M-14为优势基因。同源性分析结果显示G型比例最高,占55.0%,其次为J型,占16.4%。结论耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药机制复杂,以G型克隆株为主。临床工作中应根据药敏结果规范使用抗菌药物。

碳青霉烯类;耐药;肺炎克雷伯菌;同源性分析;超广谱β内酰胺酶

碳青霉烯类抗生素具有抗菌作用强、抗菌谱广的特点,是目前治疗多重耐药革兰阴性细菌的重要药物[1]。但是近年来,临床上对碳青霉烯类耐药率逐渐升高。耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌株的耐药机制复杂,其中产生碳青霉烯酶就是重要机制之一[2,3]。本研究通过对189株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌株进行研究,分析其耐药机制以及同源性。现将结果报道如下。

1 材料与方法

1.1 材料、仪器与试剂

选择2010年1月~2014年12月在我院分离出的189株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌进行研究。189株菌株中58株分离于痰液,47株分离于血液标本,34株分离于尿液,33株分离于胸腔积液,17株分离于分泌物。MHA培养基、血琼脂平板、亚胺培南、厄他培南、阿莫西林/克拉维酸、头孢他啶/克拉维酸、美罗培南、头孢吡肟、头孢噻肟、头孢噻肟/克拉维酸、头孢他啶、头孢西丁、呋喃妥因、四环素、复方磺胺甲唑、妥布霉素、阿米卡星、替加环素,环丙沙星药敏纸片,PCR试剂盒,DNA Marker,PCR扩增引物。全自动微生物鉴定仪、恒温培养箱、PCR扩增仪、凝胶成像系统等。

1.2 研究方法

1.2.1 药敏试验采用E-test方法检测抗菌药物对菌株的MIC,厄他培南采用纸片扩散检测抑菌圈。E-test方法:将待测菌株涂在MH平板,均匀涂抹,干燥3~10 min,将E-test条放在平板上,37℃,培养20 h后观察结果。纸片扩散:将待测菌株涂在MH平板,均匀涂抹,干燥3~10 min,中央贴厄他培南纸片一张,测量抑菌圈。结果根据2012年CLSI M100-S22文件标准进行判断。

1.2.2 改良Hodge试验大肠埃希菌ATCC25922采用直接菌落悬液方法制备0.5麦氏浊度菌悬液,用8.5 g/L氯化钠溶液1∶10稀释,涂在MH琼脂平板上,干燥3~10 min,中央贴美洛培南纸片。用拭子挑3~5个待测菌菌落或者质控菌悬液,从纸片边缘到平板边缘划直线的方式接种,37℃培养20 h。MHT阳性:接种先与大肠埃希菌抑菌环交接产生向抑菌圈内增强生长现象,说明待测菌产生碳青霉烯酶。

1.2.3 超广谱β-内酰胺酶检测待测菌0.5麦氏浊度,均匀涂在MH平板,干燥3~10 min,贴头孢他啶/克拉维酸、头孢他啶、头孢噻肟/克拉维酸。37℃孵育18 h,任一复合纸片抑菌环直径与单一纸片抑菌环直径相比≥5 mm,则为产超广谱β-内酰胺酶。

1.2.4 耐药基因PCR检测制备耐药基因检测模板。采用PCR扩增法检测碳青霉烯酶基因。获得的基因阳性菌株PCR扩增产物提纯,进行双向测序,结果与已知序列比对。

1.2.5 菌株同源性分析采用REP-PCR方法进行基因扩增,产物经琼脂糖凝胶电泳,染色,成像后拍照。根据电泳条数、长度进行同源性分析。

1.3 统计学分析

采用EXCEL表格统计数据,采用SPSS12.0统计学软件进行数据分析。计数资料采用n(%)表示,采用χ2检验,P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 耐药分析结果

189株菌株对厄他培南、头孢噻肟、头孢他啶、亚胺培南、阿莫西林/克拉维酸、氨曲南、美洛培南、头孢西丁的耐药率均超过90%。对米诺环素的耐药率相对较低,对替加环素的耐药率为0。见表1。

表1 耐药分析结果(n=189)

2.2 碳青霉烯酶检测结果及超广谱β-内酰胺酶检测结果

改良Hodge法检测碳青霉烯酶阳性率79.9%(151/189),超广谱β-内酰胺酶检测阳性率54.0%(102/189)。以PCR结果为金标准,改良Hodge法检测碳青霉烯酶存在假阳性和假阴性的情况,但是统计学比较,差异无统计学意义(P>0.05)。见表2。

表2 Hodge与PCR碳青霉烯酶基因检测结果比较[n(%)]

2.3 耐药基因测序及序列分析

KPC基因阳性率60.3%,IMP基因阳性率3.7%,Amp-C酶基因基因阳性率12.7%;162株blaSHV阳性,阳性率85.7%,其中blaSHV-11160株,为优势基因;120株blaTEM阳性,阳性率63.5%,其中blaTEM-196株,为优势基因;90株blaCTM-M阳性,阳性率47.6%,其中blaCTM-M-1468株阳性。1株菌株同时含blaKPC-2和blaIMP-4基因,3株同时有blaCTM-M-14基因和blaCTM-M-65基因,126株同时含有3种及以上耐药基因。耐药基因测序及序列分析见表3。

2.4 同源性分析

G型比例最高,占55.0%,其次为J型,占16.4%。见表4。

表3 耐药基因测序及序列分析(n=189)

表4 REP-PCR同源性分析(n=189)

3 讨论

肺炎克雷伯菌是革兰阴性杆菌,是临床上常见的病原菌,细菌有荚膜,主要的感染部位是肺部。随着广谱抗菌素在临床上的应用,ESBLs、AmpC酶、AMEs产生,目前多重耐药情况严重[4-6]。ESBLs产生、外膜孔蛋白缺失、形成生物被膜是肺炎克雷伯菌的主要耐药机制[7,8]。

亚胺培南是最早研发的碳青霉烯类抗菌药物,在1987年问世,是第一代碳青霉烯类抗菌药物,随后出现帕尼培南。1995年后,研发出第二代碳青霉烯类抗菌药物,主要是美洛培南和厄他培南。目前第三代碳青霉烯类抗菌药物已经在临床上应用,其具有更强的抗铜绿假单胞菌活性,并且有口服剂型。碳青霉烯类抗菌药物具有广谱和强大的抗菌活性,能够迅速杀菌,减少细菌内毒素的释放,对临床常见的β内酰胺酶(例如AmpC)具有高度的稳定性,对肠杆菌科细菌具有高度的敏感性,临床疗效肯定,血液透析能够清除[9,10]。既往,临床上对碳青霉烯类抗菌药耐药的菌株较少见。但随着抗菌药物在临床上的不规范使用,耐药菌逐渐出现,为临床上的治疗造成困难。

肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类的耐药机制十分复杂,与产生碳青霉烯酶、AmpC酶过度表达、外膜孔蛋白丢失、高亲和碳青霉烯类的位点数量下降或缺失,或者亲和力下降等有关[11,12]。而碳青霉烯酶的产生是重要的耐药机制之一。碳青霉烯酶由耐药菌株产生,属于一类β-内酰胺酶,能够水解碳青霉烯类药,这类酶有丝氨酸酶以及金属酶[13-15]。既往研究显示,肺炎克雷伯菌主要产生的碳青霉烯酶主要是A类和B类,而A类为丝氨酸酶,其中KPC型最常见,能够被克拉维酸所抑制;B类为金属酶,以IMP、VIM、GIM多见,能够解除氨曲南之外所有的β-内酰胺类抗生素[16-20]。

本次纳入研究的189株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌株中,耐药分析结果显示,其对厄他培南、头孢噻肟、头孢他啶、亚胺培南、阿莫西林/克拉维酸、氨曲南、美洛培南、头孢西丁的耐药率均超过90%,而对替加环素的耐药率为0,说明其对替环加素具有较好的敏感性,而对阿米卡星、妥布霉素、米诺环素等也具有一定的敏感性。耐药菌株的基因多样,且可同时表达多个耐药基因,这给临床上的治疗造成了极大的困难。替加环素是新型四环素类药物,对多重耐药的G-杆菌具有较好的抗药活性。根据本次研究的结果,在临床工作中,对于多重耐药的肺炎克雷伯菌,可首选替加环素治疗。

189株待测菌株采用Hodge试验检测,结果显示碳青霉烯酶阳性率为79.9%,以PCR方法为标准,该结果高于PCR检测结果,说明存在一定的假阳性。但是对两种检测方法的符合情况进行统计学分析,结果显示两种检测方法差异无统计学意义(P>0.05)。

耐药基因序列分析结果显示,KPC基因阳性率60.3%,IMP基因阳性率3.7%,而其中1例同时有KPC基因和IMP基因,因此,120株耐药菌株因产生碳青霉烯酶而耐药,占63.5%。另外,189株耐药菌Amp-C酶基因、超广谱β-内酰胺酶基因携带率高。162株blaSHV阳性,阳性率85.7%,其中blaSHV-11160株,为优势基因;120株blaTEM阳性,阳性率63.5%,其中blaTEM-196株,为优势基因;90株blaCTM-M阳性,阳性率47.6%,其中blaCTM-M-1468株阳性。本研究还发现126株同时含有3种及以上耐药基因,可能是多重耐药的基因基础,说明耐药肺炎克雷伯菌的耐药机制十分复杂,临床治疗也会越来越困难。耐药基因同源性分析结果显示,本医院分离出的耐药菌株以G型为主,其次为J型,其他类型相对较少。

综上所述,耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药机制复杂,在同一医院流行的耐药菌株具有相似的基因型以及耐药表型,可能与地区流行以及院内感染有关,因此在临床工作中,院内感染应重点关注多重耐药菌株的传播。另外,在临床工作中,对抗菌药物的选用,应根据药敏结果以及感染部位的血药浓度等选择最合适的药物治疗,规范化使用抗生素,减少耐药菌株的产生。

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Analysis of resistance mechanisms and homology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae

ZHANG Yun1DENG Zaichun1MA Hongying1LV Dan1WAGN Li2
1.Department of Respiration,the Affiliated Hospital of Medical College of Ningbo University,Ningbo315000,China; 2.Bacteriology Room,the Affiliated Hospital of Medical College of Ningbo University,Ningbo315000,China

Objective To analyze resistance mechanisms and homology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae.Methods From January 2010 to December 2014,189 carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniaes were analyzed, carbapenemases phenotype by Hodge,ESBLs was tested by B-last,resistance gene sequencing was tested by PCR,homologous points was detected by REP-PCR.Results Resistance rates of 189 strains to ertapenem,cefotaxime,ceftazidime,imipenem,amoxicillin/clavulanic acid,aztreonam,meropenem,cefoxitin were more than 90%.Resistance rate to minocycline was low,and to tigecycline was 0.Carbapenemases phenotype positive rate by Hodge was 79.9%,and ESBLs was 54.0%.KPC gene positive rate was 60.3%;IMP was 3.7%;Amp-C was 12.7%;162 strains of blaSHVwas positive,accounting on 85.7%,and blaSHV-11was dominant gene;120 strains of blaTEMwas positive,and blaTEM-1was dominant gene;90 strains of blaCTM-Mwas positive,and blaCTM-M-14was dominant gene.Homology analysis showed that G-type was the highest proportion of 55.0%,followed by J-type,accounting for 16.4%.Conclusion Resistance mechanisms of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae is complex,and G-type clone is main clone.The use of antibiotics should be based on susceptibility results.

Carbapenems;Resistance;Klebsiella pneumoniae;Homology analysis;ESBLs

R446.5

A

1673-9701(2015)27-0016-04

2015-08-10)

浙江省宁波市医学科技计划项目(2013A19)

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