李墨野 赵慧 姜洋 刘笑平 林永红 李开隆

摘要 [目的]用生物信息学手段分析、预测毛白杨PLC2基因/蛋白质的结构与特征，为该基因的克隆及功能研究提供理论参考。[方法]以PLC2基因及对应蛋白质为研究对象，利用各种网上数据库及生物信息学分析软件对其进行相关分析、预测。[结果]PLC2基因的GenBank登录号为JX424764.1，ORF长957bp，编码318个氨基酸，对应蛋白质PLC2的分子量35 999.1D，理论等电点7.07；PLC2与毛果杨（XP_002313726.1）的同源性较高；PLC2属于PIPLCc_GDPD_SF超家族，无O糖基化位点，无二硫键，无跨膜区和信号肽，有16个磷酸化位点。[结论]对PLC2基因/蛋白的各级结构及功能进行预测，为下一步试验奠定基础。

关键词 毛白杨；磷酸肌醇特异性磷脂酶C；生物信息学

中图分类号 S188 文献标识码 A 文章编号 0517-6611（2014）31-10867-06

Bioinformatics Analysis of Populus tomentosa cultivar BJHR01 Phosphoinositidespecific phospholipase C （PLC2） Gene

LI Moye， ZHAO Hui， JIANG Yang， LI Kailong et al

（State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding， Northeast Forestry University， Harbin， Heilongjiang 150040）

Abstract [Objective] To analyze and predict the structure and feature of Populus tomentosa PLC2 gene/protein through bioinformatics method， and provide theoretical foundation for gene cloning and function research. [Method] Utilize various online databases and bioinformatics software to predict PLC2 gene and its corresponding protein. [Result] The GenBank accession number of PLC2 is JX424764.1， ORF is 957bp in length， encoding 318aa； the molecular weight of PLC2 is 35 999.1D， theoretical isoelectric point is 7.07； PLC2 has a higher homology with XP_002313726.1， belonging to PIPLCc_GDPD_SF superfamily， has no Oglycosylation site， no disulfide bond， no transmembrane domain or signal peptide， but 16 phosphorylation sites. [Conclusion] This study has predicted the structure and function of PLC2 gene/protein and paved the way for the following experiments.

Key words Populus tomentosa； Phosphoinositidespecific phospholipase C； Bioinformatics

毛白楊（Populus tomentosa）是以黄河中、下游流域为中心而广泛分布的杨柳科落叶乔木，该树种适应能力较强，是速生用材林，为防护林和行道河渠绿化的理想选择^[1]。磷酸肌醇特异性磷脂酶C是真核生物胞内酶，在细胞信号转导过程中起着重要作用^[2]。它能催化1磷脂酶D肌醇肌糖4，5二磷酸水解成第二信使物质甘油二脂、肌糖1，4，5三磷酸的反应，这个催化作用还受到可逆磷酸化反应以及调节蛋白质的调控^[3-5]。笔者通过生物信息学手段对毛白杨（BJHR01种）磷酸肌醇特异性磷脂酶C（phosphoinositidespecific phospholipase C，PLC2）基因的核酸/蛋白质序列的分子特征、一级结构、二级结构以及三维结构进行了预测，并对该蛋白进行了系统进化分析，从而为下一步的分子生物学试验提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 材料

所选材料为毛白杨（BJHR01种）磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因，GenBank登录号：JX424764.1。……