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赤桉EcWRKY50转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析

2014-08-15王鹏良韦翠娥覃柳辉杨利平张照远

农业研究与应用 2014年4期
关键词:利用

王鹏良+韦翠娥+覃柳辉+杨利平+张照远+吴幼媚+覃子海

摘 要:WRKY转录因子参与植物生长发育、抗病虫、耐逆境等众多过程,并在其中起重要作用。为了研究WRKY在赤桉中的结构和功能,本研究利用电子克隆的方法克隆了赤桉与AtWRKY50高度同源的一个WRKY基因EcWRKY50,并利用生物信息学方法对该基因编码蛋白的氨基酸组成,理化性质,亚细胞定位和高级结构等方面进行预测和分析。结果表明,EcWRKY50基因全长为585 bp,包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸,该基因蛋白分子量为18.187 KD,理论等电点为5.45。该蛋白含有一个WRKYGKK的保守结构域和C2H2结构域,属于GroupⅡc成员,很可能在细胞质中起转录和转录调控的作用;并对该蛋白进行了同源性分析。这些研究为该基因功能的进一步分析奠定了坚实的基础。

关键词:赤桉 EcWRKY50转录因子 基因电子克隆 生物信息学分析

桉树是桃金娘科(Myrtaceae)桉树属(Eucalyptus)的总称,原产于澳大利亚及其附近岛屿。桉树生长迅速,轮伐周期短,用途广泛,经济效益显著,已经成为我国主要的短周期工业用材树种。

赤桉(Eucalyptus camaldulensis)是在澳大利亚分布最广,引种较多的树种[1 ]。赤桉其木材可制作高档家具,工艺品,还可以作为锯材、纸桨材、干材和薪炭林等重要用途,同时其对干旱[1 ],低温[2-5 ],高温[6 ]和盐碱等逆境有较好的适应能力,而且耐瘠薄。由于其良好耐逆性,赤桉已经在全世界广泛种植,而且种植面积呈日趋扩大之势。

WRKY转录因子是植物特有的最大的转录因子家族之一,WRKY转录因子由其N端的保守氨基酸WRKY而得名,由于其在不同的进化模式,从而产生了多样的WRKY基因成员[7 ]。……

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