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胡枝子属部分植物的ITS序列分析

2014-07-20赵月梅高明杰

商洛学院学报 2014年6期
关键词:物种植物分析

赵月梅,高明杰

(商洛学院 生物医药与食品工程学院,陕西商洛726000)

胡枝子属部分植物的ITS序列分析

赵月梅,高明杰

(商洛学院 生物医药与食品工程学院,陕西商洛726000)

利用ITS序列分析技术对胡枝子属植物进行了亲缘关系分析,探讨其遗传多样性及其亲缘关系,试图为胡枝子属植物资源开发利用提供依据。将从GenBank检索获得的24条胡枝子属植物(19个种)的ITS序列做系统发育分析,Clustal 2.0软件进行序列比对,Mega4.0计算序列核苷酸比例及遗传距离,并构建邻接树(Neighbor-joining tree,NJ Tree)。胡枝子的19种植物ITS序列全长为622 bp,变异位点占总序列的16.6%;K-2-P遗传距离为0.001-0.085;鉴定成功率为57.9%,19种胡枝子可以聚为3支,与形态学分类结果并不完全一致。

胡枝子属;ITS序列;系统发育

胡枝子属(Lespedeza) 为蔷薇目豆科(Leguminosae),目前约60个种,其野生种质资源丰富,分布于世界各地。该属植物用途十分广泛:常用于水土保持和土壤改良等[1],具有抗炎、抗过敏、镇痛等药理活性[2-3]。随着分子生物学技术飞速发展,DNA分子标记技术的应用为植物的遗传结构及物种鉴定等的研究提供了高效而可靠的办法。高等植物的rDNA(ribosomeDNA)是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成的高度重复串联序列,其基因组序列从5’到3’依次为:外部转录间隔区(external transcribed spacer,ETS)、18S rDNA、 内 部转录间隔区1(internal transcribed spacer,ITS1)、5.8S rDNA、内部转录间隔区2(ITS2)、26S rDNA和非转录间隔区(non transcribed,NTS)。其中18S、5.8S和26S的基因组序列由于是编码区,选择压力大,在生物种间变化小,而内转录间隔区ITS1和ITS2作为非编码区,承受的选择压力较小,序列变异较大,可以提供大量的遗传学信息[4]。因此在近缘种及易混淆的中草药中得到了广泛的应用[5-8]。……

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