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大豆耐盐基因的预测与筛选

2014-07-10原野

池州学院学报 2014年3期
关键词:大豆植物实验

原 野

(复旦大学 生命科学学院,上海 200433)

大豆耐盐基因的预测与筛选

原 野

(复旦大学 生命科学学院,上海 200433)

本研究运用生物信息学方法和实验验证,对大豆的3号染色体上Satt339~Sat304区间内耐盐相关基因进行了结构和功能预测,筛选大豆的耐盐性状相关基因。通过实时荧光PCR技术,定量分析候选基因响应于盐胁迫。

大豆;耐盐基因;生物信息学;基因筛选

作为我国重要的经济作物之一,大豆的耐盐性较敏感,尤其在我国北方地区,可用耕地多为盐性土壤,对大豆的生长影响较大。因此,找到耐盐基因,解决大豆的耐盐问题是克服土壤盐渍化的重要前提[1],是我国农业经济可持续发展的关键。已有的研究表明,植物的抗盐性是一个由多基因控制的数量性状,其抗性机制是一个十分复杂的问题[2],涉及植物器官、组织、细胞、细胞器直至分子,既有蛋白质、核酸、碳水化合物等结构和能量物质的代谢,还有激素合成、抗氧化酶活化、离子调控与区域化、渗透调节物质合成及基因表达[3],许多基因会随环境中盐浓度的改变而改变表达量[4]。而过高的土壤含盐量会对植株造成包括水分胁迫、离子胁迫、光合作用下降等多方面不利影响[5-12],等。国外文献中刊载的相关研究[13-16]是针对农作物耐盐性的研究[12,15,17,18],Mansour(2004)等主要是和对植物耐盐性状分子机理的研究。以往的研究中,对于大豆的耐盐性状研究尚显薄弱。正是基于此现状的启发,确定以大豆为研究对象,应用Softberry的ORF预测功能和美国国立生物技术信息中心(NCBI)的BLAST检索系统获取大豆基因的基因结构并进行生物信息学分析,了解基因可能的功能,高效地缩小大豆耐盐候选基因的范围。……

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