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快速检测IL-28B rs12979860基因多态性双色荧光PCR法的建立

2014-06-07刘立明李永利马洪滨王雪飞王嫣王志富毛远丽王海滨

传染病信息 2014年5期
关键词:检测

刘立明,李永利,马洪滨,王雪飞,王嫣,王志富,毛远丽,王海滨

·论著·

快速检测IL-28B rs12979860基因多态性双色荧光PCR法的建立

刘立明,李永利,马洪滨,王雪飞,王嫣,王志富,毛远丽,王海滨

目的建立一种适合临床常规检测白细胞介素28B(interleukin-28B,IL-28B)rs12979860基因多态性的快速实验方法。方法随机收集我院223例丙型肝炎住院患者外周血标本,设计针对IL-28B rs12979860基因多态性位点的特异性引物和荧光探针,直接通过双色荧光PCR法检测IL-28B rs12979860基因多态性,以基因测序法进行验证,同时初步探讨IL-28B rs12979860不同基因型在本研究人群中的分布频率。结果双色荧光PCR法能很好地鉴别IL-28B rs12979860 3种基因型,与测序法结果一致率为100%。IL-28B rs12979860基因多态性中T/T、C/T和C/C基因型在本研究人群中的分布频率分别为1.79%(4/223)、23.32%(52/223)和74.89%(167/223)。结论根据IL-28B rs12979860单核苷酸多态性基因型特异性探针和引物所建立的双色荧光PCR法能快速有效地进行rs12979860基因多态性分型,方法快速、可靠,为丙型肝炎患者抗病毒个体化治疗效果的预测提供了一种有效的检测方法。

白细胞介素-2;丙型肝炎;多态现象,单核苷酸;基因型

HCV感染是引起全球慢性肝病的主要原因之一,全球慢性丙型肝炎(丙肝)患者占全世界人口的3%[1],我国HCV感染率约为3.2%,每年新发丙肝病例约3.5万例[2]。在使用聚乙二醇干扰素(pegylated interferon,Peg-IFN)和利巴韦林(ribavirin,RBV)联合抗病毒治疗过程中有近50%的基因1型HCV感染者及近20%的基因2、3型HCV感染者未能获得持续病毒学应答(sustained virological response,SVR)(即治疗结束随访24周时,定性检测HCV RNA阴性或定量检测小于最低检测限)[3]。研究发现这种差异除了与HCV载量、基因型别等因素有关外,还与宿主的白细胞介素28B(interleukin-28B,IL-28B)基因多态性高度相关[4-5]。……

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