木薯干旱响应基因MeHDS1的克隆与分析
2014-03-21于晓玲阮孟斌王树昌彭明
生物技术通报 2014年10期
关键词:分析
于晓玲阮孟斌王树昌彭明
(1.海南大学农学院,海口 570228;2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口 571101)
木薯干旱响应基因MeHDS1的克隆与分析
于晓玲1,2阮孟斌2王树昌2彭明2
(1.海南大学农学院,海口 570228;2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口 571101)
HD-Zip是植物中所特有的转录因子,在植物体响应环境因子过程中起着重要的作用。以木薯cDNA为模板,利用RT-PCR技术从木薯中克隆了一个HD-Zip家族成员基因全长,命名为MeHDS1。序列分析结果表明,MeHDS1具有822个氨基酸,分子量89.07 kD,等电点为5.79,其开放阅读框长2 469 bp,具有典型HD结构域及START结构域。该转录因子与棉花GL2蛋白的同源性很高,推断其同属第IV亚家族。MeHDS1蛋白内含有一个核定位信号,亚细胞定位试验结果也证明,MeHDS1蛋白定位于细胞核与细胞壁中。实时荧光PCR分析表明,该基因在木薯根部表达量最高,受干旱诱导上调表达。通过对其生物信息学分析及其在木薯中表达谱分析结果表明,MeHDS1可能作为转录调控因子参与木薯非生物胁迫应答反应。
HD-Zip转录因子 木薯 表达分析 亚细胞定位
木薯(Manihot esculenta Crantz),是大戟科植物,原产于南美洲亚马逊河盆地,一年生木本灌木,是世界上第5大粮食作物,是非洲一些国家人们生存的主要食物来源[1]。木薯最大的优点是不与其他粮食作物争地,在其他作物无法生长的干旱地区,可以很好的生长。这一特性值得人们进行研究。抗旱相关基因的表达需经历逆境信号的接受、转导、诱导基因的转录以及功能基因的转录后3个不同水平的调节。……
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