环境DNA研究技术及其在生态学领域的应用
2014-04-09徐浩罗茜李云薛洋叶勤
生物技术通报 2014年10期
徐浩 罗茜 李云 薛洋 叶勤
(西南大学动物科技学院 淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室,重庆 400716)
环境DNA研究技术及其在生态学领域的应用
徐浩 罗茜 李云 薛洋 叶勤
(西南大学动物科技学院 淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室,重庆 400716)
环境DNA(environmental DNA,eDNA)是指从环境样本中提取的所有DNA的集合,包括环境微生物以及从生物体上脱落下来的活细胞DNA和因生物死亡后细胞破碎而游离出的胞外DNA。按照宏基因组学概念,eDNA研究技术主要是指直接从环境样本中提取基因组DNA后进行测序分析的方法。较传统的研究方法,eDNA应用最大的优势在于更有效地解决了特定环境样本中宏量生物的分类问题,利于更进一步研究生态学问题,该技术耗时短、成本低,准确度高。第二代高通量测序技术的开发成功,进一步拓展了eDNA的应用范围,并开始从微生物学向动、植物学领域拓展,促进了传统生态学领域在研究方法和思想上的一场革新。对eDNA的研究技术在生物多样性分析、动物食性分析、生物量估测等生态学领域的应用进行了综述,最后对eDNA研究技术的发展趋势和前景作出展望。
环境DNA 宏基因组学 生态学 物种分类
环境DNA(environmental DNA,eDNA)是指从环境中(如土壤、水、空气等)提取的所有DNA集合,包括环境微生物以及从生物体上脱落下来的活细胞DNA和因生物死亡后细胞破碎而游离出的胞外DNA[1,2]。在自然界中eDNA量的变化是一个动态过程,不断产生的同时也不断的降解,但也有如化石一样能长久存在的古eDNA[3]。……
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