黄小林， 吕国敏， 刘付永忠， 李 涛， 蔡云川， 马志洲， 黄 忠

(1. 中国水产科学研究院南海水产研究所 农业部南海渔业资源环境重点野外科学观测试验站，广州 510300；2. 广东省水产技术推广总站,广州 510222)

石斑鱼是石斑鱼属(Epinephelus)鱼类的统称，在分类学上隶属于鲈形目(Perciformes)、鲈亚目(Percoidei)、鮨科(Serranidae)、石斑鱼亚科(Epinephelinae)。石斑鱼的种类较多，全世界已记录有100多种，其中，中国有40多种。石斑鱼广泛分布于热带至温带海域，是珊瑚礁中的重要捕食者，在海洋生态中占据着重要地位。该属鱼类多为名贵的食用鱼，部分已成为重要的养殖对象，具有巨大的市场潜力。近年来，由于人类活动的影响：掠夺性开发、过度捕捞、海洋环境的污染和破坏、养殖群体的近亲繁殖、外来种侵入等，鱼类资源日益衰退[1-3]，而石斑鱼个体发育中存在先雌后雄的性转变过程，雄性亲鱼均高龄化(一般6龄以上)[4]，致使其自然资源的减少更加严重，部分种类已被世界自然保护联盟(The World Conservation Union，简称IUCN)收录到《濒危物种红皮书》(IUCN Red List )中，赤点石斑鱼(Epinephelusakaara)等被列为濒危物种[5]。

动物线粒体DNA是核外的遗传物质，具有母系遗传、序列简单、进化速率快等特点，在进化遗传学研究中得到广泛应用。线粒体全基因组序列与单个基因标记相比，前者所包含的信息量更大，能反映出物种在基因组水平的遗传特征，如基因的组成、排布等[6-9]。目前，在GenBank中已登录有6种石斑鱼线粒体基因组序列。本文在6条石斑鱼线粒体基因组研究的基础上，全面分析石斑鱼线粒体基因组的基本结构特征和变异位点，检测蛋白质编码基因在进化过程中受到的选择压力，评估不同基因在石斑鱼系统发育分析中的适用性。……