荧光定量PCR法检测线粒体基因A1555G与C1494T突变
2013-09-13林文津郭舜民徐榕青肖志勇张亚敏
林文津 郭舜民 徐榕青 肖志勇 张亚敏
1.福建省医学科学研究院 福建省医学测试重点实验室,福建福州 350001;2.福建省福州市第二医院,福建福州 350007
线粒体12SrRNA基因是氨基糖苷类抗生素导致的非综合征型听力损失的一个突变热点区域。由于A1555G和C1494T突变在12SrRNA基因形成G-C和U-A配对使得与氨基糖苷类抗生素的结合更加容易,这就是为何携带这些突变的人在接触了氨基糖苷类抗生素时会出现或加重耳聋的原因[1]。因此,对这两个点突变的检测,对于预防氨基糖苷类抗生素中毒性耳聋有着重要的临床意义。目前关于线粒体耳聋基因的检测方法有多种,文献已报道的方法有酶切法[2-3]、直接测序法[2-6]、基因芯片法[7-10]、实时荧光定量Taqman探针法[11]等。检测的突变热点主要是1555、1494、961等[12-13]。本次试验采用荧光定量PCR法检测95例非综合征药源性耳聋患者及其家属线粒体基因A1555G、C1494T突变,并采用传统的毛细管电泳测序法进行确证,现将检测结果报道如下:
1 资料与方法
1.1 一般资料
95例非综合征型耳聋患者及其家属均为汉族,其中,男44例 女51例,聋病先证者54例(男39例,女15例)。经知情同意后,首先对先证者及其家属进行病史调查,包括家族史、耳聋史及耳毒性药物的使用情况等,同时进行纯音听域测试,明确先证者均为非综合征型耳聋。
1.2 仪器与试剂
PCR扩增仪(Bio-Rad公司);ABI 3130测序仪、ABI 7500荧光定量 PCR 仪(Applied Biosystems)。Taq酶、dNTP(北京百泰克生物技术有限公司);测序引物(上海生工生物工程技术服务有限公司);药物性耳聋基因突变检测试剂盒及阳性对照试剂(智海生物工程北京有限公司)。……
