肠出血性大肠杆菌O157∶H7的快速可视化检测
2013-08-14张锦海顾海涛王长军王玉邦
吕 恒,张锦海,顾海涛,王 平,王长军,王玉邦
(本文编辑:张仲书; 英文编辑:王建东)
肠出血性大肠杆菌(enterohaemorrhagic Escherichia coli,EHEC)主要包括 O157∶H7、O26∶H11、O111和O104等几种血清型,其中O157∶H7是典型菌株[1]。该病原菌可引起人腹泻、出血性肠炎、血栓性血小板减少性紫癜和溶血性尿毒症。EHEC O157∶H7的感染具有暴发流行、强致病性、高致死率以及抗生素治疗可能加剧病情等特点[2]。因此快速、特异的检测对于该病的早期诊断及疫情的有效控制至关重要。目前我国EHEC的检测方法有显性培养基分离法、免疫磁珠富集、血清凝集等方法。但这些方法存在费时费力、检测时限长等弊端[3]。
环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术是 Notomi等[4]建立的一种核酸等温扩增技术,能在等温条件下高效、快速、灵敏、特异地扩增靶基因。该方法具有灵敏度高、特异性好、反应时间短、判定结果方便、不需要昂贵仪器等优势,可广泛用于病毒病、细菌病、寄生虫病的诊断[5-7]。本研究以 EHEC O157∶H7的编码脂多糖rfbE基因为靶序列设计引物,建立了优化的LAMP检测技术,并在此基础上应用金属离子指示剂羟基萘酚蓝(hydroxy naphthol blue,HNB)判定反应结果,使LAMP的结果判断更简单直观,可为基层医疗机构、疫情现场调查提供快速可视化的检测方法。
1 材料与方法
1.1 主要仪器和试剂 Loopamp DNA扩增试剂盒、Loopamp LA-320C实时浊度仪(北京蓝谱公司),羟基萘酚蓝(HNB)(Sigma公司),细菌基因组DNA抽提试剂盒、质粒抽提试剂盒、DNA 250bp marker等(大连宝生物公司),Eppendorf 5415R离心机(德国Eppendorf公司),BIO-RAD电泳仪(美国Bio-Rod公司),紫外分光光度计(美国 Thermo Fisher公司)。
1.2 菌株 EHEC O157∶H7,肠产毒性大肠杆菌(ETEC)、肠致病性大肠杆菌(EPEC)、肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)、肠聚集性大肠杆菌(EAEC)、宋内志贺菌菌株均由军事医学科学院馈赠;……
