聂伟伟，唐 林，韦 凤，陈龙邦，张辰宇，朱 琳，李冬海，管晓翔

(基础研究)

miR-144/451基因簇调控网络的生物信息学分析

聂伟伟，唐 林，韦 凤，陈龙邦，张辰宇，朱 琳，李冬海，管晓翔

目的 生物信息学方法是预测miRNA二级结构及miRNA靶基因的有用工具。miRNA、转录因子和靶基因之间的调控网络参与多种生理、病理活动的分子机制。文中用生物信息学方法预测mir-144/451基因簇的调控网络结构。 方法运用多个在线数据库，研究miR-144/451基因簇的上游转录因子及下游靶基因间的多个反馈和前反馈环路，对参与miR-144/451基因簇调控环路的基因进行功能聚类分析，绘制miR-144/451基因簇的核心调控网络图。结论miR-144/451基因簇与其上游转录因子GATA1有17个共调控的靶基因，与生物体蛋白磷酸化、性腺发育、上皮细胞分化、葡萄糖代谢等生化学过程密切相关，并参与胰岛素信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin，mTOR)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor，VEGF)信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、Toll样受体信号通路、ErbB信号通路及黄体酮调节卵细胞成熟等体内重要生理过程。结果对miR-144/451基因簇调控网络的生物信息学分析有助于理解其在细胞发育、细胞周期调控和肿瘤发生过程中的作用机制，为后续实验提供了理论依据。

微小RNA;miR-144/451基因簇;生物信息学;反馈环路;基因功能

0 引 言

微小RNA(microRNA，miRNA)是具有基因转录后水平调控作用的非编码单链小RNA［1］，在细胞增殖、分化、发育以及细胞凋亡等生理过程以及疾病发生发展中发挥重要作用［2］。miRNA的表达水平及活性在不同组织及不同时间内表现出明显差异［3］，其确切机制尚未明确。……