社区相关性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分子分型研究
2012-11-05潘宏升荀凤娇田素飞褚云卓
潘宏升,荀凤娇,田素飞,年 华,褚云卓*
(1.中国医科大学附属第一医院 检 验科,辽宁 沈 阳110001;2.辽宁省第三人民医院 检 验科)
目前,全球范围内由社区相关性耐甲氧西林金黄色 葡 萄 球 菌 (community-associated methicillinresistant Staphylococcus aureus,CA-MRSA)引起的感染呈逐年上升趋势,CA-MRSA与医院相关性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(hospital-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus ,HAMRSA)存在许多不同,CA-MRSA多感染无相关危险因素的健康人群,且发病年龄较轻[1]。研究发现,HA-MRSA与CA-MRSA的mec A基因的葡萄球菌基因盒(staphylococcal cassette chromosome mec,SCCmec)的基因型不同,HA-MRSA 多为Ⅰ-Ⅲ,CA-MRSA以Ⅳ、Ⅴ型为主[1]。本文应用SCC-mec基因分型、SPA分型、多位点序列(MLST)分析等方法,从多个角度了解CA-MRSA的分子生物学特点,现将结果报告如下。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株来源 收集2007年1月至2008年9月门诊及住院患者连续分离、不重复非痰标本CAMRSA菌株5例,其中浓汁3份,血液2份,详细情况见表1。
1.1.2 主要试剂及仪器 细菌基因组提取试剂盒,博日生物技术有限公司;Tag酶及PCR相关试剂,宝泰克大连生物科技有限公司;PCR引物,上海生工有限公司合成;脉冲场凝胶电泳试剂,美国Bio-Rad生物科技有限公司;PCR9700(Gene Amp);脉冲场凝胶电泳仪(美国Bio-Rad),HZQ-F160振荡培养箱(上海);超速低温离心机(贝克曼);紫外凝胶成像仪(美国Alpha Innotech)。

表1 5株CA-MRSA菌株来源的基本情况
1.2 方法
1.2.1 DNA模板提取 采用细菌基因组提取试剂盒,按照说明提取基因组DNA。
1.2.2 SCCmec基因分型 引物设计及反应参数等参 照 文 献[2]进 行,ClassB 上 游 引 物:5’-TATTTTTGGGTTTCACTCGG-3’,下游引物:5’-CTCCACGTTAATTCCATTAATACC-3’;ClassC上 游 引 物:5’-GAACATTGTTACTTAAATGAGCG-3’,下 游 引 物:5’-TGAAAGTTGTACCCTTGACACC-3’;Type2上游引物:5’-ATTGCCTTGATAATAGCCTCT-3’,下游:5’-TAA AGGCATCAATGCACAAACACT-3’。
1.2.3 基因序列分析 目的基因经PCR扩增阳性,片段大小与预计值相符,产物经上海生工有限公司纯化、测序,在GenBank比对确证,其中SPA分型的测 序 结 果 于 数 据 库 (http://www.ridom.de/spaserver/)中公布的重复序列进行比较,根据排列方式及次数确定型别。……
