基于磁性纳米颗粒微阵列技术的MT-2A基因启动子单核苷酸多态性分析
2012-09-17荣高翔
荣高翔,傅 娟
(湖南工业大学 绿色包装与生物纳米技术应用重点实验室,湖南 株洲 412007)
0 引言
金属硫蛋白(metallothionein,MT)是重金属代谢应答反应中一类重要的小分子蛋白。根据等电点和氨基酸组成的不同,发现MT基因在哺乳动物中至少有MT-1,MT-2,MT-3和MT-4等4种主要形式[1]。其中MT-1和MT-2基因表达范围最广,几乎存在于哺乳动物的所有器官或组织中,尤以肝、肾细胞为主,而且主要被镉特异性诱导[2-3]。在正常水平下,MT-2A基因型的表达量多于MT-1基因,约占所有金属硫蛋白异构体表达量的50%[4]。有报道表明,造成MT-1与MT-2A基因表达量的差异,可能与MT-2A基因启动子区域的增强子活性较强有关[5]。针对美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库中人类MT-2A基因已发现的27个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)位点中,核心启动子区域TATA盒附近-5A/G(rs 28366003)SNP位点备受关注。本文拟对湖南省株洲市某冶炼工作业人群外周血中MT-2基因核心启动子区域TATA盒附近-5A/G的SNP位点进行检测,分析该人群中基因型分布特点,以期为深入探讨我国汉族人群MT-2A基因多态性特点提供一定参考,也可为进一步探讨MT-2A基因在重金属毒性易感中的作用奠定一定基础。
1 材料与方法
1.1 研究对象
以湖南株洲某冶炼厂作业工人共288例为研究对象(均为汉族);其中,男性176例,平均年龄为(42.52±14.20) ;女性112例,平均年龄为(38.81±12.48),在研究对象知情并同意下,各抽取外周静脉血5 mL,经EDTA抗凝处理后,于-80℃保存,以备基因组DNA提取。
1.2 主要材料与仪器
MT-2A基因扩增上游引物( FP) 5’-GGG CCG CCT TCA GGG AAC TG-3’,生物素修饰的下游引物( bio-RP) 5’bio-GGA CTT GGA GGA GGC GTG GT-3’;检测等位基因特异性的野生型荧光探针(W-probe) Cy3-CGCTGCACTCCAC和突变型荧光探针(T-probe) Cy5-CGCTGCGCTCCAC ;……
