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广西甘蔗花叶病SCMV调查初报

2012-09-10颜梅新黄伟华邓展云黄诚华韦金菊

中国糖料 2012年1期
关键词:检测

颜梅新,黄伟华,邓展云,黄诚华,韦金菊

(广西壮族自治区甘蔗研究所/广西甘蔗遗传改良重点实验室,南宁 530007)

甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)引起的甘蔗花叶病是重要的甘蔗病害之一,在我国浙江[1]、福建[2]、广东[3]、广西[4]、云南[5]等地甘蔗产区普遍发生,为害严重。国内外对SCMV特性、分类地位、多样性等方面进行了研究,迄今,报道了200多个SCMV分离物CP基因序列,有的还进行全基因组序列测定[6-8],许东林等2005年对华南地区引种基地侵染甘蔗的SCMV遗传多样性进行报道[3]。广西是SCMV的主要发生地区之一,但至今尚未对全区甘蔗品种品系间感SCMV进行调查,为此我们进行了相关研究。本文简要报道广西蔗区侵染甘蔗SCMV的初步调查结果。

1 材料与方法

1.1 样品采集与总RNA提取

从广西各主要蔗区采集不同品种(品系)显症的甘蔗样品,以茎尖组培脱毒的健康植株叶片作为阴性对照。采用天根生化科技(北京)有限公司的RNAprep pure植物总RNA提取试剂盒抽提叶组织总RNA,具体步骤参考试剂盒说明书。

1.2 RT-PCR扩增

RT-PCR 扩增引物根据文献[9]合成,上游引物 SCMVF4 (5′-GTTTTYCACCAAGCTGGAACAGTC-3′;Y=C or T),下游引物 SCMVR3 (5′-AGCTGTGTGTCTCTCTGTATTCTC-3′),预期扩增产物约 700 bp。RT-PCR 用购自宝(大连)生物工程有限公司的PrimeScript One Step RT-PCR Kit Ver.2试剂盒进行,反应体系参照试剂盒说明,RT 体系:50μL 反应体系中总 RNA 约 0.08μg/μL、PrimeScript 1 Step Enzyme Mix 2 μL、2×1 Step Buffer 25 μL、引物 SCMVF4 和 SCMVR3(20 μM)各 1 μL ,用 DEPC ddH2O 补足 50 μL。 反应程序为:45℃30min;95℃ 2 min;94℃ 1min,60℃ 1min,72℃ 1min,35 个循环;72℃ 5min。 PCR 反应结束后, 扩增产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳,在UVP凝胶成像系统中观察检测结果。对部分RT-PCR产物直接送测序和BLAST比对,验证检测结果的正确性。

1.3 感病品种(品系)调查

2010年5—10月间先后从广西甘蔗研究所、驮卢、凭祥、柳州、柳城、鹿寨、百色、贵港等甘蔗主产区采集不同品种(品系)显症甘蔗样品进行SCMV RT-PCR分子检测。……

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