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基于分子动力学模拟研究P53-DNA结合域单点突变对肽段的影响

2012-08-15许朝莹

科技视界 2012年7期
关键词:体系区域结构

许朝莹

(山东师范大学物理与电子科学学院 山东 济南 250014)

0 引言

P53作为最重要的抑癌基因之一,与癌症的发生发展联系紧密,大约50%的人类癌症中存在着P53突变。P53定位于人类17p13.1染色体上,由11个外显子和10个内含子组成,能编码与核DNA结合的磷蛋白P53。人类P53蛋白由393 个氨基酸组成,有三个功能区:(1)N 端区域(1~94);(2)中间疏水区域 (94~297,DNA Binding Domain,DBD);(3)C 端区域(297~393)。DBD区域能直接与DNA结合,绝大多数肿瘤中检查到的P53突变即发生在该区域中,由两个反平行折叠片构成一个三明治样的片层骨架结构。该区域有四个保守区域,分别记为Ⅱ-Ⅴ。Ⅳ(234-255)能直接和DNA结合,单独存在时没有严格的二级结构,呈无规则卷曲状。迄今为止,对P53区域Ⅳ突变结构及生理功能缺乏深入系统的认识,对该肽段与肿瘤致病微观机制的联系尚不清楚。

P53蛋白残基的点突变、缺失以及失活在癌症的发生和发展过程中起着关键性的作用。Assaf Friedler等用NMR技术研究R249S突变对P53结构的影响,发现突变体的结构与野生态结构类似,但是β三明治片层骨架结构的柔性增加,DNA结合平面发生局部弯曲。Oded Suad等利用实验检测R249S、R249S/H168R和R249S/H168R/T123A突变对P53转活功能的影响,发现R249S突变使DBD区域结构发生变化,与DNA、蛋白质之间的相互作用消失;R249S/H168R突变能稳定P53-DNA结构,能部分恢复P53的转活功能;R249S/H168R/T123A突变进一步增强结构的稳定性。

尽管实验生物学对P53突变作了大量研究和统计,对R249残基突变影响P53结构也进行了一些研究。但是,在原子水平,P53蛋白及其突变区域的构象如何变化?与肿瘤致病微观机制有何联系?尚没见到有关报道。……

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