鸡HOPX基因的克隆及表达分析
2012-08-08张志威王维世闫晓红
张 坤,张志威,王维世,闫晓红,李 辉,王 宁
(东北农业大学动物科学技术学院,农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨 150030)
HOPX基因(Homeodomain only protein X)又名OB1(Odd homeoBox 1),其编码的蛋白是一个非HOX家族蛋白,该蛋白非常小,仅有73个氨基酸残基构成[1]。与HOX家族蛋白不同,HOPX仅有一个非典型的同源异型结构域(Homeodomain)。由于突变,该结构域不能结合DNA,而主要是参与蛋白间的互作。HOPX的作用取决于与其互作的蛋白[2]。目前已发现HOPX蛋白可与血清反应因子(Serum response factor,SRF)[3-4]、组蛋白去乙酰化酶2(HDAC2)[5]等发生蛋白互作。HOPX基因在的哺乳动物脑、胎盘、心脏、脾脏、肺脏、膀胱、平滑肌等多种组织和器官表达[6]。HOPX基因调控心脏发育[7-9]、平滑肌[10-12]、骨骼肌[13]、上皮角质细胞[14-15]以及滋养层细胞的分化[16]。很多有关癌症的研究表明,HOPX基因是一个肿瘤抑制因子,HOPX基因启动子的甲基化能导致食管鳞状细胞癌[17],子宫内膜癌[18]和胃癌的发生[19],HOPX还是肺癌和绒毛膜癌的抑制因子[20-22]。对HOPX基因的功能和调控的研究,目前多集中于哺乳动物,禽类HOPX基因的相关研究尚未见报道。本实验室的鸡组织转录表达谱分析及Northern blot分析发现,HOPX基因在鸡脂肪组织的表达量显著高于其它组织。
为深入研究该基因在脂肪生长发育过程中的作用,本研究扩增和克隆鸡HOPX基因全长的CDS区,对其进行了序列分析,采用real-time RT-PCR和半定量RT-PCR的方法,进行该基因的组织表达谱分析、该基因在东北农业大学高、低脂鸡脂肪组织发育过程中的表达差异分析以及在鸡脂肪细胞分化过程中的表达分析。本研究为开展HOPX基因在脂肪生长发育过程中的作用及其作用机制研究奠定基础。……
