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一种从富含多糖果实中提取RNA的方法

2012-07-31宋红苗徐祥彬

浙江农业科学 2012年1期
关键词:检测

宋红苗,马 杰,徐祥彬

(杭州师范大学 生命与环境科学学院,浙江 杭州 310036)

从植物组织中提取纯度高、完整性好的RNA是进行分子生物学方面研究,如 cDNA合成、Northern杂交、mRNA分离、RT-PCR、cDNA文库构建及体外翻译等的必要前提和关键。许多生物材料在提取核酸时,都会遇到多糖的污染问题。多糖的许多理化性质与RNA很相似,很难将它们分开,在去除多糖的同时RNA也容易被裹带走,造成RNA产量的减少。在沉淀RNA时,也容易产生含有多糖的RNA凝胶状沉淀,这种RNA沉淀难溶于水,或溶解后产生粘稠状的溶液。此外,多糖还可以抑制许多酶的活性[1],因此污染了多糖的 RNA样品无法用于进一步的分子生物学研究。

果实中富含多糖类物质,在提取过程中能与RNA共同沉淀,很难将其分开,从而影响RNA的质量,影响进一步的分子生物学研究。为了能获得高质量的RNA,我们对果实RNA提取技术进行了探索。通过反复探索,我们利用醋酸钾沉淀多糖,结合多次氯仿抽提和LiCl沉淀RNA的方式,得到了一个可以在冬枣、葡萄、甜樱桃、桃、番茄等含不同丰度多糖的果实中适用的RNA提取方法。

1 材料与方法

1.1 材料

供试果实有葡萄,甜樱桃,冬枣,桃子和番茄。

供试生物化学试剂有水饱和酚、氯仿、醋酸钾、Tris碱、70% 乙 醇、SDS、DEPC、NaCl和LiCl。

溶液配制参照分子克隆实验指南第2版。

RNA 提 取 液 配 制:50 mmol·L-1Tris-HCl(pH 值 9.0),100 mmol NaCl,1%SDS。

1.2 RNA提取和检测

取果实10 g,置液氮中研磨成粉末,转移至经DEPC处理过的50 mL离心管中,然后加入20 mL预热到65℃的水饱和酚/RNA提取液(7 mL水饱和酚,13 mL RNA提取液),混匀后剧烈振荡10 min,再加入10 mL氯仿,混匀,4℃静置5 min,10 000 g离心……

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