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203例汉族人群9个STR基因座的遗传多态性分析

2012-06-08张艳萍王晓梅陈先丽

中国计划生育学杂志 2012年1期
关键词:检测

张艳萍 王 琳 王 毅 王晓梅 陈先丽 程 捷 刘 庆 马 旭

国家人口计生委科学技术研究所(北京,100081)

STR是一类广泛存在于人类基因组中具有高度多态性的DNA短串联重复序列[1]。由于其分型简便快速,易于标准化,已成为目前法医鉴定中最常用的遗传标记之一。目前国内外广泛使用的Powerplex16和IdentifilerTM试剂盒在发生突变案件中不能满足法医学亲权鉴定、个体识别对系统效能的要求,需要提供更多高鉴别力的STR基因座。本文应用STR_Typer_10_vl荧光检测试剂盒对203例中国汉族无关个体的9个非CODIS系统的STR基因座包括 D11S2368、D12S391、D13S325 D18S1364、D22-GATA198B05、 D6S1043、 D2S1772、 D7S3048、D8S1132进行多态性调查,以获得其群体遗传学资料,为法医学鉴定、人类学和遗传学研究提供新的工具和相关的群体研究资料[2]。

1 材料与方法

1.1 样本

在知情同意的情况下收集本实验室亲子鉴定案件中日常积累的203份无关个体血样。

1.2 DNA提取、PCR扩增、电泳及分型

采用15%浓度的 Chlex-100提取基因组DNA。按照STR_Typer_10_vl(珠海科登生物公司)荧光标记试剂盒说明书复合扩增 D18S1364、D12S391、D13S325、D6S1043、D2S1772、D11S2368、D22-GATA198B05、D8S1132和D7S3048等9个STR基因座。在ABI310型遗传分析仪上电泳扩增产物,由GeneMapperIDv 3.2软件分析被测样品的各基因座分型。

1.3 统计分析

用 PowerStatsV 12.xls分析软件[3]统计分析,得到相关法医学参数,包括:群体的等位基因频率及杂合度(H0)、匹配率(MP)、个人识别率(DP)、非父排除率(PE)、多态性信息含量(PIC)、典型父权指数(TPI)等群体遗传学参数,并用PowerMarker软件[4]进行Hardy-Weinberg平衡检验。

2 结果

2.1 等位基因频率分布

203例中国汉族人群9个STR基因座等位基因频率分布见表1。

表1 中国汉族人群9个STR基因座等位基因频率分布(n=203)

2.2 9个STR基因座和CODIS系统基因座法……
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