基于TaqMan探针的猪繁殖与呼吸障碍综合症病毒实时荧光定量PCR方法的建立*
2012-06-07祝秀梅马全英吕志慧牟克斌
祝秀梅,马全英,杜 平,王 凡,吕志慧,牟克斌
猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒 (Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)于1987年首先出现于美国[1],由猪繁殖与呼吸综合征病毒引起。其症状主要表现为怀孕母猪流产、早产、死胎、木乃伊胎及仔猪感染后的成活率下降。PRRS的一显著特性是具有高度传染性,1987年在北美首次爆发后,迅速在全球蔓延[2-3],给畜牧业的发展带来了严重的危害。十多年来,因它给世界养猪业造成巨大经济损失而引起了科学界的关注。2006年在我国暴发的高热病,给我国的养猪业带来巨大的破坏,由于诊断不及时,未做好应对工作,使许多中小型猪场因此倒闭,养殖户损失惨重[4-5]。因此建立快速有效实用的诊断方法是防制PRRS流行的重要环节。目前的诊断方法存在操作复杂费时、灵敏度或特异性不强等缺点。普通RT-PCR易出现假阳性,且核酸染色剂(溴化乙锭,EB)对人体健康有很大的危害。
实时荧光定量PCR(Real-time PCR)具有敏感性和特异性高、重复性和稳定
性好、耗时短、无污染的特点,已成为核酸定量检测的首选方法而得到广泛应用[6-8]。本研究选用PRRSV中的最保守的ORF7基因,设计引物和探针,建立了检测PRRSV的TaqMan实时荧光定量PCR,并对体系进行了优化。分别进行特异性、敏感性、稳定性试验,并对临床样品进行检测,建立了可准确、快速检测PRRSV的方法。
1 材 料
1.1 毒株 PRRSV SY0608细胞毒均由本实验室分离、鉴定并保存PCV-2、CSFV、HCV、PRV、PPV细胞毒均为本实验室保存;临床样品采自周边地区猪场。
1.2 试剂与仪器 病毒基因组RNA提取试剂盒购自 QIAGEN 公司,Premix ExTaqTM、T4DNA ligase、反转录试剂盒、Ex-Taq聚合酶、pMD-18T、DNA Marker等均购自TaKaRa(大连)公司;……
