百脉根ISSR-PCR反应体系的建立与优化
2012-05-13富新年师尚礼闫洪唯
草原与草坪 2012年3期
富新年,师尚礼,王 赞,李 俊,闫洪唯
(1.甘肃农业大学 草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃 兰州730070;2.中国农业科学院 北京畜牧兽医研究所,北京100193)
百脉根(Lotus corniculatus)又名牛角花,是豆科百脉根属多年生草本植物,原产于欧亚温暖地区,目前,在世界各地广泛种植,具有优质、高产、抗逆性强、适口性好等特点,是一种优良牧草[1]。我国华南、西南、西北、华北等地均有分布,是温暖湿润地区极具潜力的牧草之一[2,3]。百脉根具有重要的经济、生态和社会效益,研究和开发百脉根属植物的种质资源具有十分重要的意义。目前,对百脉根种质资源遗传多样性的研究主要集中在形态学[4,5]、细胞学[6-8]以及基因工程方面的应用[9],侧重于百脉根属植物ISSR(Intersimple Sequence Repeats)分子标记的研究报道较少。因此,本试验旨在研究ISSR-PCR反应中各参数变化对实验结果的影响,并对反应体系进行优化,建立适于百脉根的ISSR反应体系,为进一步研究百脉根种群遗传多样性奠定基础。
ISSR标记是基于SSR标记技术开发出来,它避免了SSR标记开发难的缺点,是Zietkiewicz等[10]在1994年创立。基于真核生物基因组中含有大量的简单重复序列,利用单一的通用引物扩增基因组DNA,进而检测2个微卫星间DNA片段的多样性。其基本原理是在微卫星序列的一端加锚1~4个随意碱基,以此进行引物设计,PCR扩增引物两端一段反向排列的SSR序列,通过琼脂糖电泳和溴化乙锭染色,根据条带的位置和有无,进行多态性分析。……
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