濒危植物珙桐AFLP反应体系的建立及引物筛选
2012-04-29李雪萍等
李雪萍等
摘要:为研究不同生境下珙桐(Davidia involucrata Baill.)的遗传多样性,以珙桐叶片为材料优化建立珙桐的AFLP反应体系。对酶切与连接中DNA的浓度、预扩增的引物、选择扩增中Mg2+和dNTPs的浓度进行梯度比较分析。结果显示,酶切与连接过程中DNA的浓度变化对结果影响不大,预扩增的引物是否带有选择碱基对结果影响明显,选择扩增中dNTPs浓度的变化对最终谱带影响不大,而Mg2+浓度变化会对最终谱带产生影响,以1.75 mmol/L为宜。采用优化后的体系,从12对Mse I、EcoR I引物的144组AFLP选择扩增引物组合中筛选出能够得到清晰扩增谱带的7组引物组合,为今后的研究奠定了基础。
关键词:珙桐(Davidia involucrata Baill.);AFLP;体系优化;引物筛选
中图分类号:S792.99;Q503文献标识码:A文章编号:0439-8114(2012)04-0831-04
珙桐(Davidia involucrata Baill.)为珙桐科珙桐属落叶大乔木,是我国特有的单型属孑遗植物,是国家一级保护植物[1]。珙桐天然分布在贵州、湖南、湖北、陕西、四川、云南及甘肃7省,分布范围较窄,资源量较少,仅限于一些边远山区的人迹罕至之地[2]。珙桐素有“中国活化石”之称,在植物系统发育和地史变迁上有很高的研究价值,对珙桐进行遗传多样性研究,可以为有效保护和合理利用该珍稀植物提供必要的科学依据。目前对珙桐的研究多集中在群落生物学、人工繁殖与引种栽培方面[3-8]。
AFLP(Amplified fragment length polymorphism)是荷兰科学家Zabeau等[9]和Vos等[10]发展起来的一种检测DNA多态性的方法,是在RFLP和RAPD基础上发展起来的,具有很多突出的优点:所需DNA量少,不需要预知DNA序列信息,灵敏度高;多态性丰富,分辨率高,重复性好,假阳性低,可靠性高;……
