丁兰平, 马元元, 黄冰心

(汕头大学, 广东汕头 515063)

DNA条形码(DNA barcoding)是一段特殊的、可用于物种鉴定的DNA序列, 是近几年以来国际上生物分类学研究的主要热点之一[1], 其技术的发展为后现代生物分类学的研究与完善提供了有力的手段。在一定前提条件下, 它既可以用来验证已知分类群鉴定的准确性, 也可以用来发现新的物种。

简单地说, DNA条形码是通过对一组来自不同生物个体的较短同源DNA序列进行 PCR扩增和测序, 并对序列进行多重比对和聚类分析, 从而将该个体精确定位到一个已描述的分类群中, 甚至还可提供充分的信息将某些物种定位到特定的地理种群[2]。

迄今为止, 已有大量的基因片段被作为DNA条形码用于物种的鉴定[3], 既有单一序列也有组合序列[3-5], 但对于植物 DNA条形码的选择还没有一个明确的统一标准。目前, 一般认为较理想的DNA条形码标准要具有如下特征: 1)种间具有明显的变异而种内变异足够小; 2)应尽可能是相同的一段DNA片段; 3)DNA片段应足够短, 长度约700 bp左右, 便于单向测序; 4)存在高度保守区域, 便于设计通用引物;5)目标DNA条形码应包含充分的进化信息, 便于对物种进行系统地位确认[6-7]。

用 DNA条形码对物种进行鉴定具有很多优点,1)不受个体形态特征变异和发育阶段影响; 2)对形态分类难以区分的类群, DNA条形码可从基因水平上提供一种分类鉴定依据; 3)核苷酸序列数据库作为数字化平台, 能弥补形态鉴定的不足, 从而有利于加快已知物种的识别速度。……