闭福银，谢艺红，谭 毅，杨进业

广西新分离流行性乙型脑炎病毒GP0722株全基因组分子特性研究＊

闭福银，谢艺红，谭 毅，杨进业

目的对广西新分离乙脑病毒GP0722株进行全基因序列测定和分析，了解其基因组结构及毒力特征。方法应用乙脑病毒全基因组扩增引物进行RT－PCR扩增，PCR产物直接测序，拼接后得到全基因序列。应用Clustal X（1．8）、DNASTAR、Mega 4．1等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果广西新分离乙脑病毒GP0722全基因长10 965个核苷酸，从97到10 395位编码一个开放阅读框，编码3 432个氨基酸，与目前使用的减毒活疫苗株SA－14－14－2株比较，只有88．9%的核苷酸同源性，97．6%的氨基酸同源性，全基因组共存在1 222个核苷酸差异，83个氨基酸差异。与GenBank中选择的21株乙脑病毒全基因序列比较发现，其核苷酸总体差异率为0．9%～18．8%，氨基酸总体差异率为0．1%～5．2%。通过Pr M／C区段、E区段、3′NTR区段和全基因序列进行系统进化分析显示该毒株属于基因1型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒GP0722株属于基因1型，与JEV／sw／Mie／40／2004进化关系最近，与疫苗株SA－14－14－2相比关键位点氨基酸未见变异，现行使用的疫苗仍能保护GP0722引起的感染。

乙型脑炎病毒；基因；种系发生

流行性乙型脑炎（Japanese encephalitis，JE，乙脑），是由乙脑病毒（Japanese encephalitis virus，JEV）感染引起的经蚊虫传播的人兽共患急性传染病。乙脑患者的病死率高，幸存者中约30% 的人会留有不同程度的中枢神经系统后遗症［1－2］。

乙脑属于黄病毒科黄病毒属，基因组为约11kb的单股正链RNA，5′端有1型帽子结构，3′端不含poly尾。基因组只有一个开放读码框，主要编码3个结构蛋白（衣壳蛋白、膜蛋白、囊膜蛋白E）和7个非结构蛋白（NS1、NS2a、NS2b、NS3、NS4a、NS4b、NS5），基因组5′末端包括95个核苷酸，3′末端包括586个核苷酸［3］。……