李 萍，张 靖，李爱花，王 珊，谈小超，阴 彬，彭小忠

中国医学科学院 北京协和医学院 基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室，北京 100005

·论著·

小鼠大脑皮层层次特异表达基因天然反义转录物的筛选与鉴定

李 萍，张 靖，李爱花，王 珊，谈小超，阴 彬，彭小忠

中国医学科学院 北京协和医学院 基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室，北京 100005

目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测，筛选出31个可能存在NAT的基因，从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA，采用RT-PCR方法对筛选阳性基因进行鉴定并克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果31个经生物信息学预测的基因中，8个为NAT阳性。结论小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因存在NAT，NAT可能通过调控编码基因影响小鼠皮层发育。

天然反义转录物；小鼠大脑皮层；筛选；鉴定

NAT由蛋白编码基因的反义链转录产生，属于一类新的长非编码RNA，其中少数可以编码蛋白，根据其编码方式可分为两种：(1)顺式NAT(cis-NAT)：与其对应编码基因来源于相同的基因组位点，由编码有义转录物的相对链所编码，与靶基因的序列完全互补；(2)反式NAT(trans-NAT)：与编码基因来源于不同的基因组位点，与有义转录物只是部分互补[1]。NAT与对应的正义RNA(sense RNA)通过碱基互补配对，形成正义-反义转录物(sense- antisense transcript，SAT)，影响靶mRNA的稳定性或翻译[2]。1976年，Barrell 等[3]在病毒中首次发现NAT的存在，此后越来越多有功能的NAT被发现在转录及转录后水平对其对应的sense RNA 发挥调控作用。……