五莲黑猪IFN-γ基因克隆、序列分析及同源建模研究
2011-11-19王海洲,丁永贵,贾晓晖
五莲黑猪IFN-γ基因克隆、序列分析及同源建模研究
王海洲 (山东省日照市畜牧站 276800) 丁永贵 (山东省平邑县畜牧兽医局)贾晓晖 (山东省日照市畜牧兽医局)
从GenBank/DDBJ/EMBL基因库中读取猪IFN-γ基因进行序列分析设计引物,基因组中克隆了IFN-γ基因序列并分析其基因组结构,运用生物信息学技术对测序结果进行分析,同源建模分析,发现该基因由氨基末端结构域和羧基末端结构域构成。
五莲黑猪 IFN-γ 基因组 同源建模
五莲黑猪属华北型猪,是山东省地方良种,该品种毛色纯黑、适应性强、耐粗饲、肉质优良、肉味鲜美、抗病力强生长速度快、产仔数高等特点,深受日照市五莲县及鲁南地区群众的喜爱,一度成为当地的当家品种,经济杂交优势明显,是生产瘦肉猪的良好母本。随着猪肉生产日益向着瘦肉方向的发展,瘦肉率与肉质间的负相关所造成的不利影响也明显地表现出来。据报导瘦肉率较高的品种或品系,应激敏感猪(PSS猪)较多,PSE(pale, soft&exudative)肉和DFD(dark, firm&dry)肉的发生率也较高,因而导致了猪肉品质的下降,严重地影响了肉的食用价值和经济价值,鉴于国外这种情况,研究和发掘我国地方品种,对于改良生猪性能具有重要的意义。
猪干扰素-γ(interferon-gamma, IFN-γ)是一种具有强烈抗病毒、抗肿瘤和免疫调节作用的细胞因子,主要由激活的T细胞和NK细胞产生,在机体免疫系统中发挥重要作用[1,2]。研究证实,IFN-γ作为生物药剂或疫苗佐剂具有安全、高效、无毒副作用等特点[3,4]。1990年Dijikmans等[5]首先克隆了含内含子的猪IFN-γ基因。随后,Vandenbroeck等[6]又分段克隆了猪IFN-γ基因的外显子并将其拼接为完整基因后进行了原核表达。……
