膀胱癌受体酪氨酸激酶基因及蛋白的表达
2011-11-16李汉忠纪志刚严维刚石冰冰
文 进,李汉忠,纪志刚,严维刚,石冰冰
中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院泌尿外科,北京100730
受体酪氨酸激酶 (receptor tyrosine kinases,RTKs)在浸润性膀胱尿路上皮癌发生、发展中起重要作用,是启动肿瘤细胞内造成癌进展、转移和治疗抵抗性等生物学特性的信号事件级联反应的关键。本研究采用实时定量PCR芯片和蛋白芯片,检测膀胱癌RTKs mRNA及蛋白表达,以发现有前景的生物标志物及可能的药物靶点,为将靶向药物治疗膀胱癌应用于临床提供实验依据。
材料和方法
RTKs实时定量PCR芯片检测
标本来源:实验组膀胱肿瘤组织取自手术切除的标本,直径为2 cm,术后经病理检查证实为高级别浸润性膀胱尿路上皮癌,侵犯深肌层,临床分期为T2bN0M0。对照组为经病理证实的、肿瘤旁2 cm以外正常膀胱组织。
总RNA抽提及鉴定:采用Trizol一步法抽提实验组总膀胱癌组织及对照组膀胱组织RNA,抽提的总RNA用分光光度法检测其量和纯度,测定260 nm波长的吸光度以定量,测定260 nm和280 nm波长吸光度的比值以确定纯度。
实时定量PCR:聚合酶激活/变性,95℃ 10 min;扩增40个循环,95℃ 15 s;60℃ 1 min,收集荧光。
阳性结果判断:Log2(FC)>2或<-2为差异表达基因。
RTKs蛋白芯片检测
选取RayBio人细胞因子抗体芯片试剂盒,X线胶片曝光后,将胶片上的图象用扫描仪扫描并转换为灰度TIFF格式的图片文件保存。运行ScanAlyze软件,将灰度TIFF格式图片的点阵转化为数字型数据,将此原始数据储存为Microsoft Excel文件。
结 果
筛选出的RTKs差异表达基因TGFA、STAB1、SERPINE1、ANGPT2、 SPINK5、 ANGPTL1、 PROK1、MDK、CXCL9、GRN、RUNX1、VEGFA、TGFB1在膀胱癌组织中的表达显著上调,EDIL3、PTN、CCL2、PDGFD、FGF13、 KITLG、 FGF2、 SERPINF1、 TNF的表达显著下调 (图1)。
筛选出的……
