2010年北京市延庆县首批流感病例样的实验室病原学检测
2011-10-16北京市延庆县疾病预防控制中心102100崔玉娟任淑敏苏东霞
北京市延庆县疾病预防控制中心(102100)崔玉娟 任淑敏 苏东霞
2010年11月2日,北京市延庆县某小学出现了15例不明原因发热症状儿童病患,主要临床症状为发热(体温37.5℃以上)、咳嗽等。为查明疫情原因、制定有效的防治措施,及时控制、扑灭疫情并提供可靠的实验室数据,本县疾病预防控制中心应用实时荧光定量PCR技术对患者的咽拭子标本进行了甲型流感病毒、乙型流感病毒、甲1型流感病毒、甲3型流感病毒、甲型H1N1流感病毒等亚型检测。
1 材料与方法
1.1 样本采集 用带有无菌聚丙烯纤维头及聚丙烯杆的拭子采集发病3天内的病例咽拭子12份,于4℃保存下运送到实验室进行检测。
1.2 主要试剂与仪器 QIAGEN QIAamp Viral RNA Mini Kit、AgPath-IDTm onestep RT-PCR Kit(美国ABI公司)、引物(fluA、fluB、H1、H3、swfluA、swH1、RNP由北京市CDC 提供)、QIAGENQIAvac 24 Plus(德国QIAGEN公司)、离心机(德国Sigma公司)、生物安全柜(上海东联)、AB 7500 fast PCR System(美国ABI公司)。
1.3 实验方法
1.3.1 样本预处理 将12份咽拭子在涡旋振荡器上充分震荡混匀,室温静置10min。
1.3.2 核酸提取 分别取200μl预处理好的标本依照QIAGEN QIAamp Viral RNA Mini Kit试剂盒说明书进行核酸提取,最后分别得到60μl样本核酸作为扩增模板。
1.3.3 核酸扩增 按照ABI公司的AgPath-IDTm one-step RTPCR Kit试剂盒说明书对12份核酸样本进行real-time RT-PCR扩增。选择FAM荧光检测模式。
1.3.4 结果判断 阴性对照:无扩增曲线,无CT值或0。阳性对照:有扩增曲线,CT值<30。检测样本:样本有典型的扩增曲线且CT值≤37,报告样本阳性。见附表1。
2 结果
12份病例样本完成PCR扩增后,其扩增曲线显示:8份样本为fluA、RNP及H3同时阳性,1份样本七种引物探针核酸扩增均阴性,3份样本仅RNP引物探针核酸扩增阳性。见附表2、附图。
3 讨论
Real-time RT-PCR是将荧光共振能量转……
