草菇培养料中微生物总DNA的高效提取1)
2011-08-29侯立娟李玉孟丽吉林农业大学长春130118JohnBuswell陈明杰上海市农业科学院食用菌研究所宋金俤江苏省农业科学院蔬菜研究所
侯立娟 李玉 孟丽(吉林农业大学,长春,130118)John A.Buswell陈明杰(上海市农业科学院食用菌研究所)宋金俤(江苏省农业科学院蔬菜研究所)
草菇(Volvariella volvacea(Bull.:Fr)Sing.)具有较高的营养价值、药用价值、商业价值和生产价值,现已发展成为世界性栽培的食用菌之一,其产量位居世界食用菌产量的第10位。1970年以前,草菇的栽培主要以稻草生料为主,自1971年,张树庭教授采用经二次发酵的废棉栽培草菇,提高了其产量[1]。培养料在自然发酵过程中微生物区系发生了改变,但是,有关微生物的动态变化尚未见报道。DNA的PCR扩增是研究分子生物学的基本方法,提取的DNA纯度和产量对后续试验的开展至关重要,对于同一批次的培养料采用不同DNA提取方法或是不同批次培养料采用同一种提取方法其产量和质量都存在较大差异。由于草菇培养料中,腐殖酸含量较高,是土壤样品的10~100倍[2],而且还含有大量的有机质、多糖、棉酚、微生物的代谢产物以及一些杂质,其环境样品的组成较为复杂,因此,DNA的提取方法具有重要意义。本研究通过6种DNA提取方法的比较,旨在筛选出一种或几种有效提取栽培前、栽培后培养料总DNA的方法,为研究其微生物的组成奠定基础。
1 材料与方法
1.1 供试材料
栽培草菇的培养料,其主要成分为废棉(95%)、石灰(5%),含水量(65±2.8)%,pH值(9.0±0.5)。采集地为上海浦东新区的上海食用菌所高桥基地。采用5点法取样,混匀,用灭菌的聚丙烯袋收集样品,-30℃保存。
1.2 提取草菇培养料中总DNA方法
采用6种方法对草菇培养料总DNA进行提取,除试剂盒提取所用样品为0.020 0 g外,其余方法均为0.200 0 g,用液氮研磨,-30℃保存备用。……
