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ABCE1基因siRNA稳定转染小细胞肺癌细胞株阳性克隆的筛选

2011-08-21黄波王晓东郎贤平

中国医科大学学报 2011年1期
关键词:孔板细胞株克隆

黄波,王晓东,郎贤平

(辽宁医学院附属第一医院胸外科,辽宁 锦州 121000)

小细胞肺癌是恶性度极高的肿瘤,早期即发生淋巴及血行转移是其重要的临床特点。小细胞肺癌的转移是多基因参与的复杂过程[1]。研究资料表明,ABCE1蛋白能够阻断干扰素介导的2-5A/核糖核酸酶L细胞抗病毒通路,并诱导前列腺癌的发生与转移,参与结肠癌的原始免疫应答[2],但ABCE1基因与肺癌及其转移的相关报道较为罕见。因此我们构建了含有新霉素Neo基因(可用G418筛选)且带有绿色荧光的ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA表达载体,并将其转染入小细胞肺癌细胞,筛选出稳定转染ABCE1-siRNA的小细胞肺癌细胞株,为进一步研究ABCE1基因在小细胞肺癌中的作用打下实验基础。

1 材料与方法

1.1 材料

人小细胞肺癌细胞株NCI-H446由中国科学院细胞库引进。新生小牛血清购于杭州四季青公司,RPMI-1640培养基和FUGENE HD购于美国Gibco公司。菌株E.coliDH5α购于上海闪晶生物公司。pRNAT-U6.1/Neo购于上海闪晶生物公司。

1.2 方法

1.2.1 ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA载体构建:将合成的引物退火,95℃10 min后自然冷却。将pRNA-U6.1/Neo载体用BamHI/HindⅢ双酶切。使用DNA Ligation Kit将退火产物与pRNAT-U6.1/Neo载体4℃过夜连接。热转化至E.coliDH5α中,分别命 名 为 ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-1,ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-2,ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-N,涂布平板后,37℃培养过夜。从转化平板上挑取白色阳性单菌落,提取质粒并测序。

1.2.2 G418浓度的确定:将对数生长期的NCIH446细胞用胰酶消化,以3×105个/孔接种于6孔板,加入含10%胎牛血清的RPMI-1640培养基。铺板第 2 日加入不同浓度的 G418(50、100、200、300、400、500 μg/ml),每 3 d 换液 1 次,换液同时加入G418,共培养3周。

1.2.3 细胞转染及阳性克隆的筛选:转染前1 d,NCI-H446细胞用胰酶消化,接种于6孔板,加入含10%胎牛血清的RPMI-1640培养基,当细胞达到70%~80%融合时,准备转染。转染当天更换为无胎牛血清的RPMI-1640培养基,每个培养孔1 000 μl。取 FUGENE HD 10 μl,按照转染试剂∶DNA(μg)为10∶2的比例加入构建成功的载体DNA,混匀后室温孵育30 min,加入到6孔板中培养,6 h后加入100 μl胎牛血清。转染48 h后,荧光显微镜下观察转染情况。转染成功后,加入 G418(400 μg/ml)的培养液进行筛选,24 h后将转染并进行筛选的细胞按1∶10的比例传代,每3~5 d换液1次。继续培养约1周待单克隆长到相对较大的集落后,于荧光显微镜下挑取细胞集落至24孔板。于24孔板继续培养,并继续用 G418(200 μg/ml)的培养液进行筛选,约 3~5 d换液1次,待细胞长满后,将仍有荧光的细胞转入6孔板培养。6孔板长满后转入培养瓶培养,取部分作Western blot之用,根据Western blot结果确定筛选效果。

1.2.4 Western blot鉴定阳性克隆:收取部分细胞,加入预冷裂解缓冲液,剪碎,超声匀浆,低温超速离心。吸取上清液,Lowry法测定蛋白浓度,SDS-PAGE凝胶90 V电泳3 h后转印。洗膜后1%BSA封闭非特异性抗原2 h。缓冲液洗膜,与一抗(1∶250)4℃孵育过夜。洗膜后与碱性磷酸酶标记二抗(1∶200)室温下孵育2h。NBT/BCIP显色,以NC膜上出现清晰的棕褐色条带为阳性,终止显色,漂洗并干燥后避光保存。

2 结果

2.1 ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA载体的构建及连接

ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-1,ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-2,ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-N,涂布平板后,37℃过夜培养。从转化平板上挑取单菌落,测序并电泳,可见构建的质粒约6 500 bp大小(图1),选取阳性克隆的PCR产物进行测序,测序结果与设计的序列一致(图2)。

图1 构建后ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA质粒电泳Fig.1 Identification of recombinant plasmid ABCE1-siRNA

图2 构建后ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA质粒测序结果Fig.2 Sequencing analysis of recombinant plasmids and of the synthesized siRNA oligonucleotides

2.2 G418浓度的确定

将对数生长期的NCI-H446细胞用胰酶消化,接种于6孔板,加入含10%胎牛血清的RPMI-1640培养液。加入不同浓度的 G418(50、100、200、300、400、500 μg/ml),培养约 6 d 后可见各组均有细胞死亡,培养12 d后可见400、500 μg/ml G418组细胞均死亡,而其他组虽也有细胞死亡但未完全死亡,因此确定G418筛选浓度为400 μg/ml。

2.3 细胞转染及阳性克隆的筛选

应用FUGENE-HD转染48 h后可见ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-1、ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-2、ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-N 转染效率可达50%以上。因构建的ABCE1-siRNA含有绿色荧光蛋白,转染后荧光显微镜观察细胞胞质内可见绿色的荧光(图3),转染质粒后NCI-H446细胞略肿胀,部分细胞变圆、死亡。经 G418(400 μg/ml)筛选2周后,大多数细胞死亡,仅少数细胞存活,并形成克隆(图4)。将形成克隆的细胞挑至24孔板,继续培养并用半量G418(200 μg/ml)筛选,培养约3周后,细胞形成较密集的克隆。将细胞消化传代至6孔板,继续培养并用半量 G418(200 μg/ml)筛选,培养约2周后单个细胞均形成小克隆时,转入培养瓶中继续培养,约3周后细胞长满培养瓶(图5)。收集细胞,部分细胞行Western blot鉴定。在筛选过程中发现转染ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-1、ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-2后,细胞在筛选过程中增殖明显减慢,证实干扰ABCE1基因后NCI-H446细胞增殖减慢。

图3 转染ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA 48 h的NCI-H446细胞×100Fig.3 NCI-H446 cells transfected with ABCE1-siRNA for 48hours×100

图4 经G418筛选2周后形成克隆的NCI-H446细胞 ×100Fig.4 Clonal NCI-H446 cells after screening two weeks by G418×100

图5 扩大培养的稳定转染NCI-H446细胞 ×100Fig.5 Stable transfection NCI-H446 cells after expanding culture×100

2.4 ABCE1-siRNA对ABCE1蛋白表达的影响

Western blot检测ABCE1蛋白表达水平,可见68 kDa处有1条特异条带。凝胶成像系统灰度扫描ABCE1现色条带,转染ABCE1-pRNAT-U6.1/NeosiRNA后,将筛选克隆并扩大培养的细胞与未转染的细胞相比,ABCE1蛋白表达量明显下降(图6)。表明ABCE1-siRNA能够抑制小细胞肺癌细胞ABCE1基因表达,同时表明ABCE1-siRNA稳定转染入NCI-H446细胞株,并筛选出了沉默ABCE1基因的稳定转染细胞株。

图6 Western blot结果Fig.6 Western blot of ABCE1

3 讨论

小细胞肺癌的发生是一个多因素、多阶段的过程。尽管放疗、化疗、生物治疗以及手术治疗在治疗小细胞肺癌方面取得了一定的进展,但小细胞肺癌的复发和转移仍然是一个巨大的难题[3]。目前己经初步认识到小细胞肺癌的发生、发展、侵袭和转移是人体细胞基因组结构和功能异常所致。

ABCE1基因定位于常染色体4q31上,属于ATP结合盒多基因家族成员之一。它在真核细胞胞质内编码一种名为核糖核酸酶L(ribonuclease L,RNase L)抑制因子的68 kDa蛋白,能够阻断干扰素介导的2-5A/核糖核酸酶L细胞抗病毒通路,抑制细胞凋亡过程,并可在促进蛋白质合成及细胞增殖分化方面发挥作用[4]。RNA干扰是指在生物细胞内,外源性或内源性的双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)引起与其同源mRNA的特异性降解,从而抑制其相应基因表达的过程[5]。由于这种技术具有效率高、特异性强、显效快、可以向子代遗传和同时进行多基因研究等优点,使其很快成为了基因研究的热点。本研究构建了ABCE1基因的siRNA表达载体ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-1、ABCE1-pRNAT-U6.1/Neo-siRNA-2、ABCE1-pRNAT-U6.1/NeosiRNA-N。该载体含有Neomycin抗性基因作为筛选标签,用于稳定转染。同时该载体于起始端含有CMV启动子,在CMV下方携带有绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)报告基因,可用于观察转染效率。将ABCE1-siRNA转染入小细胞肺癌细胞NCI-H446,经过G418筛选近3个月,获得稳定转染ABCE1的siRNA细胞株,经Western blot鉴定达到持续沉默ABCE1的效果。

为了获得稳定转染的细胞株,细胞的转染效率是十分关键的因素。转染率太低不易筛选稳定克隆,一般要求转染效率要高于30%。影响转染效率的主要因素有:(1)细胞状态:健康的细胞培养物是成功转染的基础;(2)血清:无血清转染时的转染率明显高于血清存在情况下的转染率,因此在转染前要去除血清;(3)DNA质量:DNA 要高纯度、无菌,最好是无内毒素的;(4)转染试剂和DNA的比例及培养时间:在本研究中按照FUGENE-HD说明书进行预实验时,我们应用了不同的脂质体与核苷酸的比例,包括 5∶2,6∶2,7∶2,8∶2,9∶2,10∶2,12∶2。实验结果证实,针对NCI-H446细胞进行FUGENE-HD转染的可靠条件为:转染时间为48 h时达到最大转染率,脂质体与核苷酸的用量比例为10∶2。本实验通过以上细节的调整,转染效率可达50%以上。为进一步获得稳定转染的细胞克隆,我们应用了G418进行筛选,筛选约2周左右可见单克隆形成。应用200μl加样枪挑取有荧光的单克隆后,继续应用G418(200μg/ml)筛选约2个月后,我们获得了稳定转染细胞株。该稳定转染细胞株的成功筛选为进一步研究ABCE1基因对小细胞肺癌的作用打下了实验基础。

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