应用DNA芯片技术筛选禽致病性大肠杆菌和尿道致病性大肠杆菌的差异表达基因
2011-05-21宦海霞刘秀梵
宦海霞,张 科,陈 祥,高 崧*,刘秀梵
(1.淮阴师范学院生命科学学院,江苏 淮安 223300;2.扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室,江苏 扬州 225009;3.淮安出入境检验检疫局,江苏 淮安 223300)
禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)可引起家禽呼吸道感染(气囊炎和肺炎)、心包炎、肝周炎和败血症等局部或全身性感染,给养禽业造成严重的经济损失。APEC和尿道致病性大肠杆菌(Uropathogenic Escherichia coli,UPEC)均能够引起广泛流行的肠道外疾病,这与其毒力特性有关。已知的毒力因子包括血清型、黏附素、铁获得系统、毒素、保护素和侵袭素等,这些毒力因子使它们能够在宿主环境中生存进而造成宿主发病[1-5]。因此,UPEC和APEC可能在适应肠道外的生活方式上有相似之处,并体现在毒力基因的组成和表达上。
本研究利用基因芯片技术对APEC E058株毒力基因在鸡体内、外不同培养条件下进行差异表达检测,同时对E058与UPEC HEC4株在LB和人尿液中培养条件下的差异表达基因进行检测,探讨毒力基因、潜在毒力基因在E058菌株中的表达差异,为寻找APEC新的致病基因和探索APEC与UPEC相关性提供依据。
1 材料和方法
1.1 菌株及实验动物 APEC E058株(O2血清型)由本实验室分离、鉴定并保存[6-7];人UPEC分离株HEC4由扬州市第一人民医院奚群英医生惠赠;实验鸡由山东家禽所购进SPF种蛋孵化获得。
1.2 主要试剂、芯片及仪器 采自25岁~30岁的2个月内未服用抗生素类药物的健康妇女的尿液,经过滤除菌后用于细菌培养;DNA Marker、Taq酶和Klenow酶购自TaKaRa公司;PCR试剂盒和dNTP购自Promega公司;Cy5-dCTP(红色)和Cy3-dCTP(绿色)均购自Amersham公司;9 mer Random Primer购自上海英骏生物技术有限公司;……
