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垂穗披碱草ISSR反应体系的正交优化

2011-04-25刘新亮赵来喜

草业科学 2011年5期
关键词:体系

刘新亮,德 英,赵来喜

(1.中国农业科学院草原研究所,内蒙古 呼和浩特 010010; 2.中国农业科学院研究生院,北京 100081)

垂穗披碱草(Elymusnutans)为禾本科(Gramineae)小麦族(Triticeae)披碱草属(Elymus)多年生疏丛型草本植物,又名钩头草、弯穗草[1],染色体组构成为StStYYHH(2n=42)[2]。国外主要分布于俄罗斯、土耳其、印度、蒙古等地,我国主要分布于西北、西南、华北地区[1]。垂穗披碱草根茎分蘖能力强,具有极强的抗寒性和抗旱性,能适应各种不同类型的土壤,滩地、沟谷、阴坡山麓地带到灌丛草甸和高山草甸均能生长。开花期前垂穗披碱草质地柔软,无刺毛、刚毛,无异味,为马、牛、羊喜食牧草,整个生长季节粗蛋白含量变化幅度较小,属中上等品质牧草[1-6],同时也是最具经济意义的草种[7-8]。简单序列重复区间(inter-simple sequence repeat,ISSR)是Zietkiewicz等[9]于1994年创建的以重复序列的单一引物为主要引物序列的PCR标记,它结合了SSR和RAPD的优点,主要特点是操作简单,遗传多态性高,重复性好,耗资少,模板DNA用量少。基于这些优点,ISSR分子标记已广泛应用于牧草种质资源鉴定、牧草遗传多样性与分类进化、DNA指纹图库的建立、亲缘关系分析、遗传图谱构建、分子标记辅助育种等方面的研究[10]。ISSR分子标记在披碱草属植物研究中的应用多见报道[11-12],而其在垂穗披碱草研究中应用相对较少。ISSR分子标记反应条件易受模板DNA、dNTPs、Mg2+、TaqDNA聚合酶、引物等因素的影响,ISSR扩增结果,若以单因素试验,难免忽视其互作效应,而正交试验能够分析各因素之间的内在规律,具有均衡分散、整齐可比和效应明确的优点,能较快地找到最优组合,找出影响扩增的主要因素和次要因素[13]。……

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