田潇娜， 刘国红， 刘 波， 林营志

(1.福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福建 福州 350003； 2.福建农林大学生命科学学院， 福建 福州 350002)

芽胞杆菌(Bacillus)是一种革兰氏阳性菌，能够产生对热、紫外线、电磁辐射和某些化学药品具有强抗性的芽胞，能在多种不良环境下存活，分化形成具有特殊功能的菌株。因此，芽胞杆菌在工业、农业、医学、科学领域中被广泛应用，为了更高效地利用芽胞杆菌资源，对芽胞杆菌系统学进行研究，对其分类鉴定方法进行改进就非常必要。

自20世纪90年代以来，分子生物学方法在芽胞杆菌的分类鉴定中得到广泛应用，如DNA-DNA杂交同源性分析、G+C含量分析、16S rRNA序列分析等。16S rRNA因进化速率缓慢，基因产物功能保守，其序列分析是目前细菌的主要系统发育分类方法。但16S rRNA分子较小、包含的信息量也较少，对于亲缘关系较近的细菌一般分辨率较低，存在一定的局限性，只能大概在属的水平上区分细菌，种水平的分类单元一般通过DNA-DNA杂交来鉴定。但DNA-DNA杂交不仅操作复杂，而且操作过程受很多因素影响，因此杂交结果不稳定。随着科学技术的发展，利用系统发育标记基因进行芽胞杆菌的鉴定越来越多，即以进化速率不同的分子为研究对象，进行芽胞杆菌系统发育关系分析。近年来，不断有新的分子标记基因被发现并使用。分子标记基因可以反映生物个体或种群基因组中某种特异性DNA片段的差异，一般所选择的靶基因主要分为2类，即非蛋白编码基因与蛋白编码基因，作为分子标记应具备的条件[1]为：基因普遍存在于各种细菌；……