APP下载

人类博卡病毒HBoV1基因组克隆及启动子活性分析

2011-02-10李京京孙彬欧阳锦凤陈莹韩虎刘凯于李毅

生物工程学报 2011年6期
关键词:检测

李京京,孙彬,欧阳锦凤,陈莹,韩虎,刘凯于,李毅

1 华中师范大学生命科学学院,武汉 430079

2 湖北师范学院生命科学学院,黄石 435002

呼吸道病毒是引发婴幼儿呼吸道疾病的主要病原体,目前仍有许多新病毒被不断发现。2005年,Allander等[1]采用随机 PCR扩增及生物信息学分析,从下呼吸道感染患儿标本中检测到一种新的病毒,命名为人博卡病毒 (Human bocavirus,HBoV)。随后,许多国家相继报道发现HBoV感染,且在患有肠胃炎的小儿粪便中也鉴定出人博卡病毒[2]。HBoV主要感染 2岁以下婴幼儿,临床症状主要表现为咳嗽、发热常伴有重症哮喘[3],伴随其他呼吸道病毒共感染[4-5]。基因组序列分析表明,该病毒与牛细小病毒 (BPV) 及犬微小病毒 (MVC) 在系统发育上接近,将其归属于细小病毒亚科博卡病毒属。最近,在胃肠道疾病患者的粪便中又发现了 3种不同基因型的人博卡病毒 HBoV2、HBoV3和HBoV4[6-8],证明博卡病毒不仅是小儿呼吸道感染的病原体,还会引发包括成人的病毒性肠胃炎疾病。

HBoV为单链、线状 DNA病毒,全长约5 200 nt,由位于基因组左端的唯一启动子启动基因转录[9],该特征与红细胞病毒属、貂阿留申病毒属的许多病毒相同,如人细小病毒B19基因组由唯一启动子 P6调控 12种转录子合成[10-12]。2个主要开放阅读框 (ORF) 分别编码非结构蛋白 NS1和衣壳蛋白VP1/VP2,一个次要ORF编码NP1,其功能未知。由于博卡病毒属其他2个成员基因组两端都具有ITR序列,该结构对病毒DNA复制起着重要作用[13],推测博卡病毒也具有ITR序列,但目前还未得到相关序列。Dijkman等首次报道,在HBoV1感染的假分层人气管上皮细胞中检测到 6个转录产物,且通过real-time PCR检测到病毒复制[9]。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

检测
QC 检测
小波变换在PCB缺陷检测中的应用