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甜菜离子注入诱变高糖性状的QTL分析

2010-03-23沙红王燕飞高文伟曲延英张立明

中国糖料 2010年3期
关键词:甜菜高糖亲本

沙红,王燕飞,高文伟,曲延英,张立明

(1.新疆农业科学院经济作物研究所,乌鲁木齐830091,2.新疆农业大学农学院,乌鲁木齐830052)

甜菜离子注入诱变高糖性状的QTL分析

沙红1,王燕飞1,高文伟2,曲延英2,张立明1

(1.新疆农业科学院经济作物研究所,乌鲁木齐830091,2.新疆农业大学农学院,乌鲁木齐830052)

利用离子注入诱变突变体高糖材料S10与中糖F104构建高糖F2群体,通过800条RAPD,20对SSR引物的筛选及F2群体63个单株田间性状的调查,运用Mapmaker/expversion3.0和QTL2.0软件进行高糖性状QTL分析,获得了包含16个标记位点的7个连锁群,覆盖甜菜染色体总长度的418.9cM,确定了3个与甜菜高糖性状相关的QTL位点。

甜菜;高糖;RAPD和SSR;QTL

甜菜是我国北方重要的糖料作物。与世界甜菜种植先进国家相比,我国甜菜单产、含糖率相对较低,选育优良高产高糖甜菜品种是解决问题的根本途径[1,2]。分子标记辅助育种技术在现代农作物育种中得到广泛应用,尤其是水稻、棉花等。而目前,分子育种在甜菜育种刚起步。本试验是在新疆农业科学院经济作物研究所朱小平、王燕飞等同志的工作基础上进行更深一步的研究[3]。

1 材料和方法

1.1 群体构建

离子注入诱变高糖突变体材料S10,中糖F104互为母本,配置杂交组合,F1自交获得F2群体。

1.2 DNA提取与RAPD和SSR标记分析

1.2.1 DNA提取与纯化改良SDS法,详参考沙红等人[4]。

1.2.2 RAPD和SSR标记分析800条RAPD随机引物和20对SSR引物对亲本进行多态性筛选,用亲本间有差异的SSR引物对F2群体的所有单株进行PCR扩增和电泳检测。甜菜RAPD反应体系为25μL反应液中:10×Buffer(100mmol/L Tris-HCl,100mmol/L KCl,80mmol/L(NH4)2SO4,0.5%NP-40)2.5μL;2.5mmol/L Mg2+;0.3mmol/L dNDPs;1U Taq酶;引物0.3μM;DNA模板30~50ng。反应程序:95℃预变性5min;94℃变性lmin,37℃退火lmin,72℃延伸2min,40个循环;72℃延伸5min;4℃保存。采用1%琼脂糖凝胶电泳,电压3.5v/cm。溴乙锭染色[3]。SSR扩增体系为10μL的PCR反应体系含:10×Buffer(20mmol/L MgSO4,100mmol/L Tris-HCl,100mmol/L KCl,80mmol/L(NH4)2SO4,0.5%NP-40)0.8μL;0.8mM dNTPs;0.5U Taq酶;模板DNA30ng;1nM引物并上覆的矿物油。PCR反应程序:94℃3min;94℃1min,57℃1min,72℃1min,35个循环;72℃10min;4℃保存。扩增产物在用8%的PAGE电泳检测。

1.3 性状考察及QTL定位

1.3.1 性状考察高糖F2群体作一年生栽培,10月20日单株检糖。

1.3.2 QTL定位用Mapmaker/expversion3.0进行连锁图的构建和QTL2.0软件作高糖性状QTL2.0定位。

2 结果与分析

2.1 RAPD和SSR标记多态性筛选

RAPD标记800条引物出现稳定的特异性只有173条。不同引物扩增出的谱带数差异较大。SSR标记中20对引物有10对在两亲本间存在差异,表现出多态性,且扩增条带多,清晰,多态性好。在亲本之间表现出多态性。扩增产物的分子量在300~3000bp,主要集中在500~2000bp。经多次重复,确定19条RAPD引物和6对SSR引物对甜菜高糖亲本S10,中糖亲本F104及其F2代63株进行PCR扩增。

2.2 遗传连锁图谱构建

2.2.1 基于F2群体连锁图谱构建RAPD和SSR标记的偏分离分析25个多态性位点中,来源于父本的位点数为12个,来源于母本的位点数为13个。X2适合性测验表明,在25个RAPD标记中,有9个标记为偏分离标记。利用Mapmaker/expversion3.0软件设置最小LOD值为3.0和最大重组率为50cM,初步构建了1个包括7个连锁群16个标记位点的甜菜分子连锁图谱,16个RAPD和SSR标记,覆盖甜菜染色体总长度的418.9cM,标记间平均图距为19.9cM。根据连锁群的长度,由大到小依次将7个连锁群命名为Lg1~Lg7。在21个标记中,标记在连锁群上分布不均匀,标记最多的只有6个标记,最少的只有2个标记。

2.2.2 区间作图法结合考察田间检糖结果,用MAPMAKER/QTL VERSION 1.1b程序进行区间作图法的QTL定位,取LOG值为3.0,确定与高糖性状相关的QTL位点3个,见表1和图1。

SC1-1 QTL位点位于ssr13-2~ssr13-4之间,加性效应为1.77,显性效应为0.36。

SC1-2位点位于ssr13-4~ssr11-1之间,加性效应为1.83,显性效应为0.45。

SC2位点位于ssr11-2~ssr4之间,加性效应为1.37,显性效应为0.47。

3 讨论

表1 F2群体区间作图QTL定位结果(LOD>3.0)

图1 利用F2群体构建的7个分子标记连锁图谱

3.1 利用RAPD和SSR标记多态性筛选

在试验中利用800条引物RAPD标记对两亲本扩增,出现稳定的特异性只有173条,不同引物扩增出的谱带数差异较大;而SSR标记中20对引物有10对在两亲本间存在差异,表现出多态性。说明在本试验中RAPD标记特异性较SSR差,其主要原因可能是:RAPD标记相对要求模板DNA质量高,同时受RAPD本身重复性、稳定性的限制,从而影响扩增条带多态性和特异性。

3.2 分子标记群体的构建

甜菜为两年生大样本异花授粉作物,同时甜菜染色体复杂、倍性多样,构建标记群体难度大。在分子标记群体构建中对群体数量有一定的要求,以保证所有的遗传信息得到充分的表达,从而获得与性状相关联的分子标记位点。本试验中最终符合要求的F2群体63株,这对位点的确定和与性状连锁的紧密程度略有影响。

[1]王燕飞,董心久,张立明,等.再谈新疆甜菜生产和含糖率[J].中国糖料,2009(3):69-71.

[2]卢秉福,韩卫平,祁勇.甜菜种植比较效益分析[J].中国糖料,2009(3):39-41.

[3]朱小平,王燕飞,沙红,等.甜菜离子注入诱变高糖突变体的RAPD分子标记筛选[J].新疆农业科学,2008,45(2):313-316.

[4]沙红,王燕飞,曲延英,等.一种适于甜菜RAPD分析的DNA快速提取方法[J].新疆农业科学,2005,42(3):162-164.

QTL Analysis of Impregnating Ion into High-sugar Mutant Sugarbeet

SHA Hong1,WANG Yan-fei1,GAO Wen-wei2,QU Yan-ying2,ZHANG Li-ming1
(1.Institute of Industrial Crops,Xinjiang Academy of Agriculture Sciences,Urumchi 830091,China; 2.College of Agriculture,Xinjiang Agriculture University,Urumchi 830052,China)

S10 is one of the parents as high sugar content mutant induced from ion impregnation,and F104 is as mid-sugar contentin this experimentin Xinjiang.Based on the 800 RAPD,20 pair makers and information of 63 plants from F2populations,the data were analyzed by strips using Mapmaker/expversion3.0 and QTL2.0.The results showed that seven Linkage pedigree of 16 molecular marks,covering 418.9cM of sugarbeet chromosome length,three QTLs were detected and linked to high sugar content(at the levelof LOD>3).

Sugarbeet;High sugar content;RAPD and SSR;QTL

S566.3;Q78

A

1007-2624(2010)03-0027-02

2010-03-18

新疆维吾尔自治区科技厅“十一五”攻关项目(200631103)。

沙红(1974-),女,江苏省启东县人,助理研究员,主要从事植物生物技术与分子生物学研究。

王燕飞(1955-),女,江苏省启东县人,研究员,研究方向:甜菜和油料作物育种与栽培。E-mail:yanfeidj@xaas.ac.cn

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