新馆位于上海交通大学闵行校区中心位置。定位为主馆兼理工生医农科综合馆，2008年12月开馆运行。

建筑面积为35000平方米，采用一门式管理，体现大开放、大服务格局，实现“藏、查、借、阅、参”一体化服务，综合阅览空间之外，设置若干小组学习讨论室和小型研讨会议室，使图书馆成为支持不同学习方式、研究习惯和使用需求的信息共享空间和学术交流中心。同时，重点建设以读者为中心的服务主导型数字图书馆，为读者提供各类资源立体覆盖的网络化、数字化集成学习环境。

秉承“读者第一，服务至上”宗旨，创建了“资料随手可得，信息共享空间；咨询无处不在，馆员走进学科；技术支撑服务，科研推进发展”的服务理念。周开放时间为98小时。目前拥有印刷型馆藏图书308万册、期刊5000余种，以及大量多媒体等非书馆藏。同时，拥有电子数据库298个(折合印刷型资源约330万册)，其中包括全文电子期刊近3万种、电子图书127万余册、学位论文92万余篇。

加上新馆，上海交通大学图书馆总面积达63700平方米，阅览座位6000余席。由闵行校区主馆(兼理工生医农科综合馆)、闵行校区包玉刚图书馆(人文社科综合分馆)、徐汇校区包兆龙图书馆(管理与社科分馆)、卢湾校区医学院图书馆以及若干院系分馆和资料室组成文献资源服务体系，成为资源丰富、设施先进、管理现代的开放式、综合性、国际化研究型图书馆。