APP下载

一株产低温蛋白酶菌株的筛选、鉴定及生长特性的研究

2014-05-10张晓燕古丽娜孜库米拉陈卫林王小标王雪薇韩艳鹏

食品工业科技 2014年5期
关键词:蛋白酶菌株低温

张晓燕,古丽娜孜,库米拉,陈卫林,王小标,杨 静,王雪薇,韩艳鹏,武 运

(新疆农业大学食品科学与药学学院,新疆乌鲁木齐830052)

生活在低温环境下的微生物称为低温微生物,主要分为嗜冷菌(psychrophiles)和耐冷菌(psychrotrophs)两类,前者是指在0℃可生长繁殖,最适温度不超过15℃,最高温度不超过20℃的细菌、真菌和藻类等微生物[1];后者是指在0~5℃可生长繁殖,最适生长温度可达20℃以上的微生物。低温微生物能够在低温条件下产生一些具有较高催化效率的低温酶,来维持细胞新陈代谢的正常运行[2]。

目前,对低温蛋白酶的研究主要集中在从极地、冰川、雪山、深海等长年极冷环境选育产酶的冷适微生物、通过化学诱变和物理诱变筛选高产低温蛋白酶菌株[3]、冷适蛋白酶提纯及酶学特性研究[4]、从分子水平解析适冷机制并进行化学修饰保护酶的热稳定性[5]。低温蛋白酶具有低温易反应,高效活力,热损失少等优点,因此,在食品、环境修复、化妆用品、医药等领域有着中温蛋白酶无法比拟的优越性[6-7]。对于陆地常冷环境冻土、高海拔地区产冷适蛋白酶菌株鲜有报道。本文基于新疆冻土资源充裕,以新疆阿勒泰进山口植物根际冻土为材料,旨在应用微生物发酵法筛选产低温蛋白酶菌株,筛选出一株产冷适蛋白酶的菌株,16S rDNA鉴定为沙雷氏菌(Serratia sp.),这为冷适蛋白酶的进一步提取纯化、研究酶学特性奠定基础,为开发新疆特色果蔬加工低温酶制剂提供理论与技术支持,为新疆丰富的果蔬加工工业提供方便、高效、快捷的非热加工方式,来保持果蔬及果蔬制品特有的风味,色泽,营养。

1 材料与方法

1.1 材料与仪器

土样采自新疆阿勒泰进山口,采集时间是2012年3月,采集时环境温度为0~10℃。将土样置于无菌铝盒中,做好标记,放置保温箱中当天运回,-20℃保存备用;ZP301细菌基因组 DNA提取试剂盒、DL2000 PlusDNAMarker、ZT2012 × TaqPCR MasterMix(含染料)、10mg/mL EB染色液 北京庄盟国际生物基因科技有限公司;primer1:(5'-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3')primer2:(5'-AAG GAG GTG ATC CAG CCG CA-3')华大基因;革兰氏染色液[8]、1mol/L pH8.0 Tris-HCl、20mg/L 蛋白酶K 上海百祥生物科技有限公司;10mg/mL溶菌酶北京百泰克生物技术有限公司;50×TAE(Tris-乙酸)、1%溴酚蓝指示剂 北京索莱宝科技有限公司;0.5μg/mL EB 染色液[9];液体富集培养基 葡萄糖1.00%,蛋白胨0.50%,酵母浸粉0.50%,MgSO4·7H2O 0.02%,K2HPO40.10%,NaCl 1.00%,Na2CO31.00%,pH 7.2;LB培养基 蛋白胨1.0%,酵母浸粉0.5%,NaCl 1.0%,(固体加2%的琼脂),pH 7.2;选择培养基 酵母浸粉0.1%,NaCl 1.0%,酪蛋白2.0%,琼脂2.0%,pH 7.2。培养基均在 121℃灭菌 20min后,待用。

LD2X-30KA立式电热压力蒸汽灭菌锅 上海申安医疗器械厂;HR40-ⅡA2生物安全柜 青岛海尔特种电器有限公司;DHP-9162电热恒温培养箱上海一恒科技有限公司;DZKW-D-2电热恒温水浴锅 北京市永光明医疗仪器厂;XSP-2CA生物显微镜 Motic实业集团有限公司;FA2104N分析天平 上海民桥精密科学仪器有限公司;THZ-98A恒温振荡箱 上海一恒科学仪器有限公司;050-810Tgradient48 PCR扩增仪 德国Biometra公司;DYY-7B电泳仪 北京六一仪器厂;JY04S凝胶成像仪 北京君意东方电泳设备有限公司;MiniSpin离心机 德国Eppendorf公司。

1.2 实验方法

1.2.1 菌株驯化 在容积100mL的三角瓶内装50mL生理盐水,放几颗玻璃珠,121℃灭菌20min,冷却后在无菌操作台上,将土样加到无菌生理盐水中,制成 1%土壤悬浮液,摇匀,待用。(注意:每隔20min震荡一次,震荡数次充分混匀后,在无菌操作台上,静置30min)

在500mL三角烧瓶内装50mL液体富集培养基,在121℃灭菌20min后冷却,在超净工作台上准确移取5mL上述1%的土壤悬浮液,加入到三角烧瓶中,在20℃ 200r/min培养1天,待用。

1.2.2 产低温蛋白酶菌株的初筛 在无菌操作台上,分别取驯化好的菌悬液0.5mL,加入到4.5mL无菌生理盐水中,用梯度稀释法得到不同稀释度的稀释液,即 10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7。每个稀释度做两个平皿,分别移取0.1mL的菌液,移入凝固干燥后的固体初筛培养基平皿中,用涂布棒涂匀,在20℃的培养箱中恒温培养24~48h,观察有无透明圈出现,将初筛得到的产酶菌株,挑单个菌落,在选择培养基上点样,20℃培养24~48h后,加入10%的TCA终止反应,测量菌落直径以及透明圈直径。每个菌株做三个平皿,平行测量三次,取平均值。在菌落边缘可看到透明圈的菌株即为要筛选的菌株。

1.2.3 产低温蛋白酶菌株的复筛 蛋白酶活力的测定:按照国标GB/T23527-2009规定的福林酚显色法(Folin)测酶活进行菌株的复筛,蛋白酶活性定义:在pH7.0和40℃温度条件下,每分钟水解酪蛋白产生1μg酪氨酸,定义为一个蛋白酶活力单位。同一个样品测三次,取平均值。

1.2.4 产低温蛋白酶菌株鉴定 用肉眼观察平板上单个菌落的颜色、大小、形状等特征,记录;再用革兰氏染色法观察菌株的显微镜形态,按照文献[10]对菌株进行初步鉴定。按照文献[11-12]进行菌株生理生化鉴定,通过李远[13]等的方法扩增菌株的16S rDNA,扩增成功的PCR产物,送至北京六合华大公司测序,获得的测序结果递交GenBank数据库中Blast,进行相似同源性分析,Maximum likelihood法绘制系统发育树,BOOTSTRAP分析法,选取重复1000评估树的准确性。

1.2.5 菌株生长曲线及产酶曲线的绘制 将菌株接入液体培养基中,在22℃的摇床中150r/min进行培养,通过连续测定(每隔2h)液体培养基中细菌的OD600nm吸光值及酶活力,确定菌株生长状况及产酶情况,绘制生长曲线和产酶曲线。

1.2.6 菌株A29-2生长特性的初步研究 将活化好的种子液以1%的接种量接入液体培养基中,通过连续测定液体 OD600nm吸光值,研究菌株在 4、18、20、22、25、28、30、37℃下的生长情况。测定菌株在初始pH为4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0 及质量分数 0.00%、0.25%、0.50%、1.00%、2.00%、4.00%、8.00%的 NaCl中22℃培养24h后的生长量。

2 结果与分析

2.1 产低温蛋白酶菌株的筛选

通过平板分离初筛及复筛方法,在20℃培养条件下恒温孵育48h后加入10%的TCA溶液终止反应,从植物根际土壤中筛选出9株产低温蛋白酶菌株,表1是水解透明圈d1与菌落直径d2测量结果。

从图中可以看出,菌株A29-2和A29-3透明圈与菌落直径之比d1/d2的值均大于3.00[14],后续工作中测得菌株A29-2和A29-3的酶活力依次是31.88U/mL和7.04U/mL,说明透明圈的大小与酶活力的大小成正相关,故此方法可用于筛选产低温蛋白酶菌株[15]。菌株A29-2的酶活力较大,作为后续工作的研究对象。

表1 菌株筛选的结果Table 1 Results of strains screening

2.2 菌株鉴定

2.2.1 菌株形态学鉴定 菌株A29-2在酪蛋白分离培养基上形态特征如图1所示:单个菌落表面圆滑湿润,凸起,规则圆形,呈乳白色,边缘整齐,不透明。显微镜下的形态如图2所示为单细胞呈短杆状,不规则排列,革兰氏阴性,无芽孢,有荚膜。

图1 菌株A29-2的平板特征Fig.1 Plate characteristics of strain A29-2

图2 菌株A29-2的镜检特征Fig.2 Microscopic characteristics of strain A29-2

2.2.2 生理生化鉴定 研究结果见表2:菌株A29-2可分解葡萄糖、果糖、蔗糖、麦芽糖、L-阿拉伯糖、D-半乳糖、D-棉籽糖、D-木糖、甘露醇、甘露糖、密二糖、海藻糖产酸产气,不能分解乳糖、水杨苷产酸。M-R实验、H2S实验、吲哚实验为阴性;接触酶实验、V-P实验、硝酸盐还原实验、明胶液化实验、柠檬酸盐实验为阳性;石蕊牛乳实验结果为牛奶结块凝固,不变色或蓝色,即酶凝。说明菌株A29-2具有产低温蛋白酶的能力。

2.2.3 菌株A29-2的16S rDNA鉴定 由图3可知,菌株A29-2 PCR扩增出的条带在1500bp左右,说明成功的扩增出菌株A29-2的16S rDNA片段;将菌株A29-2的测序结果,通过NCBI进行16S rDNA数据库BLAST,选取序列相似度达99%的部分菌种,采用软件DNAman和 Mega5.05,Maximum likelihood法制作系统发育树,结果见图4,菌株 A29-2与标准菌株NR_042356.1在同一支系,相似率达到99%,故菌株A29-2鉴定为沙雷氏菌(Serratia ureilytica strain_NiVa 51)。

表2 菌株A29-2生理生化鉴定结果Table 2 Physiological and biochemical identification results of strain A29-2

图3 菌株A29-2 PCR电泳胶图Fig.3 PCR electrophoresis gel figure of strain A29-2

2.3 菌株生长特性的初步研究

图4 菌株A29-2的系统发育树Fig.4 The phylogenetic tree of strain A29-2

2.3.1 菌株A29-2的生长和产酶曲线 通过连续测定液体培养基中菌株A29-2的OD600nm吸光值,由图5可知,菌株A29-2在22℃环境中能较快生长,4~18h为对数生长期,培养18h后基本达到稳定期;在最初的8h内酶活力几乎没有;20h后才渐渐开始产酶,此时菌株处于稳定期;随着菌株逐渐衰亡,产酶能力也越来越强,说明酶的产生发生在菌株生长的中后期。

图5 菌株A29-2的生长和产酶曲线Fig.5 The growth curve and enzyme production curve of strain A29-2

2.3.2 温度对菌株A29-2生长的影响 温度对菌株A29-2生长的影响如图6所示,菌株A29-2在4~30℃均能生长,且最适生长温度为22℃,37℃不生长,表明该菌是低温菌。在不同温度下,培养18h后均陆续进入稳定期,且18h的生长量最大;随着温度的升高,菌株到达生长高峰的时间提前,加速了菌株的死亡。

图6 温度对菌株A29-2生长的影响Fig.6 The effect of temperature on the growth of strain A29-2

2.3.3 初始pH对菌株A29-2生长的影响 初始pH对菌株A29-2生长的影响如图7所示,菌株A29-2在初始pH为6.0~8.0生长较快,最适初始pH为7.0。

图7 初始pH对菌株A29-2生长的影响Fig.7 The effect of initial pH on the growth of strain A29-2

2.3.4 NaCl质量分数对菌株A29-2生长的影响NaCl质量分数对菌株A29-2生长的影响如图8所示,NaCl质量分数为0.00%~1.00%时,菌株A29-2生长最快,且最适NaCl质量分数为1.00%。

图8 NaCl质量分数对菌株A29-2生长的影响Fig.8 The effect of mass fraction of NaCl on the growth of strain A29-2

3 结论

本研究通过微生物发酵法分离筛选出9株产低温蛋白酶菌株,其中菌株A29-2所产低温蛋白酶活性最高,为31.88U/mL。通过微生物学鉴定方法对菌株A29-2进行形态学、生理生化及16S rDNA鉴定,经序列同源性分析,鉴定该菌属于沙雷氏菌(Serratia sp.),该研究与迟乃玉等[15]、刘静等[16]、全桂静等[17]学者分离筛选所得的菌种有所不同,本研究得到一株新菌种,并对新菌种的生长特性进行初步探讨,菌株A29-2生长最适温度为22℃,且在4℃可以生长,37℃不生长。根据耐冷菌能够在0~5℃左右生长,最适生长温度约20℃左右的特性,可以确定该菌为耐冷菌。且最适初始pH为7.0,在pH10.0时生长最缓慢,pH4.0时生长较缓慢,因此,该菌耐碱性差,但具有一定的耐酸性。该菌最适NaCl质量分数为1.00%,超过1.00%时,菌株生长加速死亡,所以,该菌具有一定的耐盐性。本研究筛选的菌株A29-2为进一步提取纯化低温蛋白酶和研究酶学特性奠定了基础。

[1]Morita R.Y.Psychrophilic bacteria[J].Bacterial Rev,1975,39:144-167.

[2]Gerday C,Aittaleb M,Bentahir M,et al.Cold-adapted enzymes:from fundamentals to biotechnology[J].Trends in Biotechnol,2000,18(3):103-107.

[3]王长远,罗梦晓.高产蛋白酶地衣芽孢杆菌株的紫外诱变[J].中国生物制品学杂志,2012,25(5):620-622.

[4]祁丹丹,杨瑞金,华霄,等.天山冻土中产低温蛋白酶菌株的筛选、鉴定及酶学性质[J].食品与发酵工业,2012,38(7):32-37.

[5]Vazquez SC,Coria SH,Cormack WPM.Extracellular proteases from eight psychrotolerant antarctic strains[J].Microbiol Res,2004,159(2):157-166.

[6]陈秀兰,张玉忠,高培基.低温蛋白酶的研究进展与应用前景[J].工业微生物,2001,31(1):52-57.

[7]Margesin R,Dieplinger H,Hofmann J,et al.A cold-active extracellular metalloprotease from Pedobacter cryoconitis:production and properties[J].Research in Microbiology,2005,156(4):499-505.

[8]黄秀梨,辛明秀.微生物学实验指导[M].北京:高等教育出版社,2008:19-23.

[9]魏群.分子生物学实验指导[M].北京:高等教育出版社,2007:25-26.

[10]周德庆.微生物学实验教程[M].北京:高等教育出版社,2006:49-51,220-225.

[11]东秀珠,蔡妙英.常见细菌系统鉴定手册[M].北京:科学出版社,2001:66-95.

[12]Buchanan R E,Gibbens N E.伯杰细菌鉴定手册(第八版)[M].北京:科学出版社,1984:450-454.

[13]李远,巴吐尔,张小燕,等.新疆哈萨克族传统发酵驼乳中乳酸菌的分离鉴定[J].中国食物与营养,2011,17(1):54-58.

[14]马桂珍,暴增海,王淑芳,等.高产蛋白酶细菌的分离筛选及其种类鉴定[J].食品科学,2011,32(21):183-187.

[15]迟乃玉,张庆芳,王晓辉,等.海洋低温蛋白酶菌株选育及发酵培养基的研究(I)[J].微生物学通报,2006,33(1):114-117.

[16]刘静,闵航,章骥,等.一株产低温蛋白酶菌株的筛选鉴定及纯酶研究[J].浙江大学学报,2006,32(3):251-256.

[17]全桂静,尹黎献.低温碱性蛋白酶高产菌株的选育与发酵条件研究[J].沈阳化工大学学报,2011,25(2):117-120.

猜你喜欢

蛋白酶菌株低温
蛋白酶对禾花鱼消化酶活性的影响
不同蛋白酶酶解制备鸡肉小肽的工艺条件研究
植物根际促生菌Bacillus mycoides Gnyt1菌株生物学特性比较研究
菌株出马让畜禽污染物变废为宝
大型低温制冷技术新突破
关于麦芽中蛋白酶的分解研究
金属丝大变身
思乡与蛋白酶
零下低温引发的火灾
英国红松鼠携带麻风病菌株