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mNGS 技术联合GM 试验、血清烟曲霉特异性抗体检测对COPD合并侵袭性肺曲霉菌病的诊断价值

2024-04-20王卓萍胡小燕胡慧佳张燚超金军

现代实用医学 2024年2期
关键词:曲霉菌特异性测序

王卓萍,胡小燕,胡慧佳,张燚超,金军

慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一种常见的呼吸系统疾病,随着疾病进展,患者肺功能逐渐下降,导致呼吸困难、持续咳嗽和反复急性加重[1]。由于COPD 患者的肺部环境易于细菌和真菌定植,因此更容易发生各种呼吸道感染。侵袭性肺曲霉菌病(invasive pulmonary aspergillus,IPA)是一种由曲霉菌引起的严重肺部感染,在COPD患者中的发生率逐年上升,其临床表现与其他呼吸道感染相似,但进展迅速,若不及时诊断和治疗,可能导致患者死亡[2]。目前,IPA 的诊断主要依赖临床表现、影像学检查和微生物学检测等,传统的微生物学检测方法,如直接镜检和培养,虽然诊断准确率较高,但耗时较久[3]。近年来,宏基因二代测序(mNGS)技术逐渐应用于各种感染性疾病的诊断,可快速、准确地检测出样本中的微生物DNA,为临床诊断提供高效的工具[4]。半乳甘露聚糖(galactomannan,GM)试验和血清烟曲霉特异性抗体检测也是诊断IPA 的常用工具,本研究旨在探讨mNGS技术联合GM 试验、血清烟曲霉特异性抗体检测对COPD 合并IPA 的诊断价值,现报道如下。

1 资料与方法

1.1 一般资料 采用前瞻性研究,纳入2020 年8 月至2023 年8 月杭州市第九人民医院收治的96 例COPD患者。纳入标准:(1)符合COPD 诊断标准[5];(2)存在疑似IPA 的临床表现(如发热、持续咳嗽、胸痛、血痰等);(3)胸部影像学检查显示肺部浸润、空洞形成等可能与IPA 相符的表现;(4)临床资料完整。排除标准:(1)已明确诊断为肺结核、肺癌等其他呼吸系统疾病;(2)有严重肝肾功能障碍、已知其他真菌感染。本研究获得杭州市第九人民医院伦理委员会批准,所有研究对象均同意参加本研究并签署书面知情同意书。

1.2 方法

1.2.1 mNGS检测 从患者的支气管肺泡灌洗液中提取总DNA,采用QIAamp DNA Mini Kit 进行DNA 提取;使用专门针对微生物的16S rRNA 引物进行PCR扩增,PCR 反应条件:94℃预变性5min,94℃变性30s,35 个周期,55℃退火30s、72℃延伸1min,最后72℃延伸7min。使用IlluminaMiSeq 平台进行测序,使用QIIME 2 软件进行数据分析,与NCBI 微生物数据库进行比对,在样本中检测到曲霉菌DNA序列,且其在所有微生物中的相对丰度超过1%,判定为阳性。

1.2.2 GM 试验 从患者血液中提取血清,存储于-20℃;采用PlateliaAspergillusGM试剂盒,按照厂家说明书进行操作,通过酶标仪读取450nm的吸光度值。

1.2.3 血清烟曲霉特异性抗体检测 从患者血液中提取血清,存储于-20 ℃;使用烟曲霉IgG ELISA试剂盒,将样本加入预先包被有烟曲霉抗原的酶标板孔中,孵育1 h;采用洗涤缓冲液洗涤3 次,去除未结合的物质,加入与IgG抗体结合的酶标记二抗,孵育30 min,重复洗涤步骤,加入TMB底物,孵育20min,然后加入停止液;通过酶标仪读取450 nm 的吸光度值,使用标准曲线来确定抗体浓度。

1.3 COPD合并IPA的诊断标准 参照欧洲癌症研究和治疗组织/侵袭性真菌感染协作组(EORTC/MSG)的共识标准[6],(1)临床表现:持续发热且广谱抗生素治疗无反应,存在呼吸困难、持续咳嗽、胸痛及血痰;(2)影像学检查:胸部CT 显示“新月体”征、“空洞”形成、“卫星病灶”;(3)微生物学证据:从呼吸道分泌物或肺组织中直接观察到曲霉菌的分枝菌丝,从肺组织或支气管肺泡灌洗液中分离出曲霉菌;(4)组织病理学证据:肺组织活检发现曲霉菌侵袭性生长,如曲霉菌的菌丝穿透肺泡壁、出现组织坏死。

1.4 统计方法 采用SPSS 22.0 统计软件进行数据分析,计量资料以均数±标准差表示,采用独立样本t 检验;计数资料采用2检验;联合检测中一项阳性则结果为阳性,绘制ROC曲线分析各检测方法的诊断价值。P <0.05 表示差异有统计学意义。

2 结果

2.1 两组一般资料比较 根据诊断标准,最终96例患者中合并IPA组40例,非IPA组56例,IPA组男24例,女16例;年龄45~78岁,平均(62.3±8.5)岁;COPD病程3~15年,平均(9.45±3.58)年。非IPA组男34例,女22例;年龄43~77岁,平均(60.1±7.9)岁;COPD 病程2~14年,平均(8.76±3.37)年。两组一般资料差异无统计学意义(均P>0.05)。

2.2 mNGS 检测结果 mNGS 检出阳性44 例,其中真阳性36例,阴性52例,其中真阴性48例,见表1。

表1 mNGS 检测结果 例

2.3 两组血清GM 值及烟曲霉IgG 抗体水平比较IPA 组血清GM 值及烟曲霉IgG 抗体水平均高于非IPA 组(均P <0.05),见表2。

表2 两组血清GM 值及烟曲霉IgG 抗体水平比较

2.4 血清GM 值及烟曲霉IgG 抗体水平对IPA 的诊断价值分析 ROC曲线显示,血清GM值、烟曲霉IgG抗体水平诊断TPE的最佳截断值分别为0.64、77.32kAU/L,对应的AUC 分别为0.804、0.807,联合诊断AUC 为0.865,见表3。

表3 血清GM 值及烟曲霉IgG 抗体水平对IPA 的诊断效能

2.5 mNGS 联合GM 试验、血清烟曲霉IgG 抗体检测对IPA 的诊断效能 mNGS 联合GM 试验、血清烟曲霉IgG 抗体检测诊断IPA 的敏感度、特异度、准确度分别为96.88%、92.19%、93.75%,与最终诊断结果的一致性检验Kappa 值为0.86,见表4。

表4 mNGS 联合GM 试验、烟曲霉IgG 抗体检测对IPA 的诊断效能

3 讨论

IPA的临床表现多样且具有非特异性,临床确诊有一定难度,传统诊断方法如微生物培养和组织病理学检查耗时较长,可能导致诊断延迟而延误病情[7-8]。因此,寻找一种快速、准确的IPA 诊断方法,对于改善COPD 患者的疗效和预后具有重要意义。

mNGS是近年来迅速发展的一种高通量测序技术,其核心原理是通过对样本中的所有DNA进行测序,然后与已知的微生物数据库进行比对,从而实现对病原体的快速、准确鉴定[9-11]。在IPA 的诊断中,mNGS可在短时间内直接从患者样本中检测到曲霉菌DNA,从而为早期诊断提供依据[12]。本研究结果显示mNGS技术在IPA的诊断中敏感度高达90.0%,这是因为mNGS可在短时间内检测到大量微生物的DNA,且与传统微生物培养方法相比,mNGS不受微生物生长速度、培养条件等因素的限制,因此更为敏感。mNGS 单独诊断IPA 的特异度为85.7%,提示存在一定的假阳性率,可能原因是mNGS 检测的是曲霉菌DNA,而不是活菌,因此即使在没有活性感染的情况下也可能检测到曲霉菌的DNA,从而导致假阳性结果。此外,环境中的曲霉菌污染、样本处理过程中的交叉污染等因素也可能导致假阳性结果。

GM 是曲霉菌细胞壁的组成部分,在曲霉菌的生长和复制过程中会释放到体内,因此其在血清中的存在与曲霉菌的活性侵袭有关,且血清中的GM 水平在感染早期显著升高,因此GM 试验常被用作IPA 的早期和快速诊断工具[13]。本研究结果显示IPA 组血清GM 值高于非IPA 组,与文献[14]报道结果一致。ROC曲线分析显示,血清GM 值对IPA 诊断的最佳截断值为0.64,单独诊断特异度高但敏感度较低,原因是GM试验在感染初期或菌量较低的情况下容易出现假阴性。在免疫系统受到侵袭时,机体会产生特异性抗体来应对病原体感染,因此检测烟曲霉特异性IgG 抗体水平可提供患者免疫状态相关信息。本研究结果显示IPA组血清烟曲霉特异性IgG抗体水平高于非IPA组。IPA 通常病程较长,烟曲霉IgG 抗体水平的升高可能会持续较长时间,而不像一些其他免疫标志物(如C反应蛋白)那样迅速升高和下降,这也导致一些早期或轻度感染可能会漏诊[15]。本研究结果显示mNGS 技术、GM试验及血清烟曲霉IgG抗体检测三者联合诊断,敏感度、特异度、准确度均较高,与最终诊断结果一致性较好,原因是三种诊断方法各自具有其优点和局限,通过联合检测可互相弥补局限性,从而提高诊断敏感性。mNGS技术在早期感染就能检测到病原体,而早期感染可能在其他诊断方法中产生假阴性结果,但mNGS 可以更早捕获感染信号,同时也有助于确定治疗后是否存在潜在耐药或其他复杂情况;GM 试验和IgG 抗体检测早期敏感性较低,但可用于监测治疗效果或复发感染,三者联合诊断可减少漏诊或误诊的可能性。

利益冲突 所有作者声明无利益冲突

作者贡献声明 王卓萍:实验操作、论文撰写;胡小燕、胡慧佳、张燚超、金军:数据整理、统计学分析

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