盐胁迫下基于TMT技术的罗布麻蛋白质组学分析
2024-03-08刘旭洋张晓明
甄 熙,刘旭洋,张晓明,宛 涛*
(1 内蒙古农业大学 草原与资源环境学院,呼和浩特 010019;2 内蒙古自治区人工影响天气中心,呼和浩特 010051;3 内蒙古自治区气候中心,呼和浩特 010051)
蛋白质组学是研究整个生物体内全套的蛋白质组及其动态变化规律的科学[1-2],植物蛋白质组学主要通过对植物在特定条件下蛋白质表达的种类、水平以及修饰状态进行鉴定,解析蛋白质功能和蛋白互作的机制[3]。目前,定量蛋白质组学检测方法主要有2种:iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)和TMT(tandem mass tags)[4]。李俊良用iTRAQ 方法对甜菜(Betavulgaris)在盐胁迫下的蛋白质表达进行分析,发现差异蛋白主要通过参与渗透调节、光合作用和能量代谢等过程抵抗盐胁迫[5]。Chen等对耐盐和盐敏感2个玉米品种进行盐胁迫处理,通过iTRAQ 方法共鉴定出1 056种差异表达蛋白,差异蛋白主要与苯丙素生物合成、淀粉和蔗糖代谢以及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路相关[6]。有人用TMT 技术分析了金银花(Lonicerajaponica)的耐盐性,发现苯丙素类生物合成和单萜类生物合成途径的相关基因上调表达,差异蛋白主要参与能量代谢和碳水化合物代谢过程途径以增强耐盐性[7]。
近年来对罗布麻(ApocynumvenetumL.)的相关研究主要集中在药用成分、遗传多样性和盐胁迫耐受性等方面[8-10]。对于罗布麻在盐胁迫条件下的适应机制研究大多数都集中在生理和表型方面,也有一些研究试图从分子机制方面阐明罗布麻的耐盐机制。基于转录组水平研究发现黄酮类物质与罗布麻提高耐盐性有关,由于黄酮类化合物的积累,转基因拟南芥比野生型拟南芥表现出更高的耐盐性[10]。……
