俱乐部始建于 2005年 12月，时称上海东亚足球俱乐部，由上海东亚（集团）有限公司和上海根宝足球俱乐部基地有限公司共同出资建立。

球队首次参加职业联赛，获得中国足球协会乙级联赛（南区）第7名。

夺得中国足球乙级联赛冠军，成功冲甲。

代表上海队参加全运会男子足球甲组比赛并夺得冠军。该赛季，上海东亚足球俱乐部获得中国足球协会甲级联赛第4名。

首次代表上海参加沪港球会杯并击败香港公民足球俱乐部，获得冠军。

以中甲冠军的身份升入中超，武磊以17个进球卫冕中甲联赛本土最佳射手。11月获得沪港球会杯三连冠。

成为首支蝉联全运会男子足球项目冠军的球队。获得中国足球协会超级联赛第9名，武磊首次获得中超联赛本土最佳射手。11月实现沪港球会杯四连冠。

因净胜球的劣势屈居中国足球协会超级联赛第5名，武磊以12球蝉联联赛本土最佳射手。11月18日，上港集团完成对俱乐部的整体收购。

获得中国足球协会超级联赛第2名，首次获得亚洲冠军联赛资格，武磊以14球第三次蝉联联赛本土最佳射手。

上港集团足球俱乐部获得中国足球协会超级联赛第3名，武磊连续4年加冕联赛本土最佳射手。12月23日，切尔西足球俱乐部中场奥斯卡加盟上港集团足球俱乐部。

连续三届获得全运会男足甲组比赛冠军。获得中国足球协会超级联赛第2名，颜骏凌获得中国足球协会超级联赛最佳门将，武磊连续第5年获联赛本土最佳射手。

提前1轮获得中国足球协会超级联赛冠军，武磊荣膺联赛最佳射手奖、最有价值球员奖，颜骏凌获最佳守门员奖。这是该队历史上和上海足球历史上第一个中超联赛冠军。

首次奪得中国足协超级杯冠军。获得中国足球协会超级联赛第3名。

1月13日，上海上港俱乐部正式更名为上海海港足球俱乐部。

10月29日，上海海港提前一轮在主场拿下中超冠军。这是海港队史的第二个中超冠军。